员工工作三个月后被公司辞退，其赔偿情况确实需要根据具体的辞退原因和相关法律法规来确定。以下是对此问题的详细解答：
一、合法辞退情形及赔偿
过失性辞退（无需支付经济补偿）
- 如果员工在试用期内被证明不符合录用条件，或者存在严重违反公司规章制度、严重失职、营私舞弊等法定过错行为，公司可以合法辞退员工，且无需支付经济补偿。
非过失性辞退（需支付经济补偿）
- 如果公司因客观情况发生重大变化（如经营困难、业务调整等）导致劳动合同无法履行，且双方未能就变更劳动合同内容达成协议，或者员工因病、因能力问题不能胜任工作且经过培训或调整岗位仍不能胜任，公司可以提前通知或额外支付一个月工资后解除劳动合同，并需支付经济补偿。
- 经济补偿标准：按劳动者在本单位工作的年限计算，每满一年支付一个月工资的标准。对于工作三个月的员工，应支付半个月工资的经济补偿。
二、违法辞退情形及赔偿
- 如果公司辞退员工不符合上述法定情形，即构成违法解除劳动合同。
- 赔偿标准：公司应支付赔偿金，标准为经济补偿标准的二倍。对于工作三个月的员工，应支付一个月工资的赔偿金，或选择恢复劳动合同关系。
三、特殊情况及处理
未签劳动合同
- 如果员工入职三个月内公司未与其签订劳动合同，且在此期间被辞退，员工有权要求公司支付自用工之日起满一个月的次日至解除劳动关系之日期间的双倍工资差额。
未缴纳社会保险
- 如果公司未依法为员工缴纳社会保险费，员工在被辞退时还有权要求公司补缴社会保险费。
四、赔偿金额的计算依据及注意事项
- 月工资定义：指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。对于入职仅三个月的员工，通常以实际发放的工资为准。
- 最高限额：若劳动者月工资高于当地职工月平均工资三倍，经济补偿或赔偿金的标准将按职工月平均工资三倍的数额支付，且支付年限最高不超过十二年。
- 证据保留：在处理辞退纠纷时，双方应保留好相关证据，如劳动合同、工资单、辞退通知等，以便在必要时进行举证和维权。
五、建议
- 对于公司而言，应依法行事，确保辞退行为的合法性，避免不必要的法律纠纷。
- 对于员工而言，应了解自己的权益，依法维护自身合法权益。如果遭遇违法辞退，可以及时向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
综上所述，员工工作三个月后被公司辞退的赔偿情况需根据具体辞退原因和相关法律法规来确定。希望以上解答能对您有所帮助。