在职期间申请劳动仲裁，公司通常会知道。以下从不同角度为你详细分析：

1. 仲裁程序要求：

   • 劳动仲裁的申请和受理过程，通常需要申请人（即员工）向劳动争议仲裁委员会提交书面仲裁申请，并按照要求提供相关证据材料。
   • 仲裁委员会在受理申请后，会向被申请人（即公司）送达仲裁申请书副本及开庭通知书等法律文书。这意味着，从程序上讲，公司必然会知晓员工已经提起了劳动仲裁。

2. 公司应对策略：

   • 一旦公司收到仲裁申请书副本，它通常会开始准备应对策略，包括收集证据、准备答辩材料等。
   • 公司也可能会主动与员工进行协商，试图通过和解或调解的方式解决争议，以避免仲裁或诉讼带来的不利影响。

3. 对员工的影响：

   • 员工在职期间申请劳动仲裁，可能会对公司与员工之间的关系产生一定影响。公司可能会对员工产生不信任感，或者对员工的工作安排、职业发展等方面产生顾虑。
   • 但同时，员工也有权依法维护自己的合法权益。如果员工认为自己的权益受到了侵害，且无法通过协商或调解解决争议，那么申请劳动仲裁是一种合法的维权途径。

4. 保密性考虑：

   • 虽然仲裁程序本身并不要求完全保密，但员工在申请仲裁时，可以尽量保持低调，避免在公司内部广泛传播仲裁事宜，以减少不必要的负面影响。
   • 同时，员工也可以与公司协商，看是否能够达成保密协议，以保护双方的隐私和商业秘密。

建议：

• 如果你正在考虑在职期间申请劳动仲裁，建议你先仔细评估自己的权益受到侵害的程度，以及通过仲裁解决争议的必要性和可行性。
• 如果你决定申请仲裁，建议你提前准备好相关证据材料，并咨询专业律师的意见，以确保自己的权益得到充分保护。
• 在仲裁过程中，保持冷静和理性，积极配合仲裁委员会的工作，以争取最有利的仲裁结果。

如果你有任何关于劳动仲裁或其他劳动法律问题的疑问，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律意见和帮助。