针对您提出的“股东纠纷案件撤诉怎么处理”这一问题，这实际上涉及到了股东撤资纠纷的解决流程以及撤诉后的相关处理。以下是我为您提供的详细解答：
一、股东撤资纠纷的基本处理流程
在股东撤资产生纠纷时，通常的处理流程包括明确撤资前提与依据、协商解决与评估影响、股权转让与公司减资，以及必要时通过法律途径解决纠纷。
明确撤资前提与依据：
- 股东撤资需基于公司章程或相关法律规定进行。首先应查阅公司章程，了解是否有关于股东撤资的具体条款。
- 若章程中未明确规定或规定不明确，股东通常不能随意撤资，但可通过股权转让方式退出，此过程需严格遵守《公司法》关于股权转让的规定。
协商解决与评估影响：
- 股东之间应通过友好协商，就撤资金额、方式、时间安排等关键问题进行坦诚交流，力求达成一致。
- 协商过程中应充分考虑公司实际运营状况及其他股东利益，并评估撤资行为对公司可能造成的财务、经营等方面的影响。
股权转让与公司减资：
- 若选择股权转让，需明确是内部转让还是外部转让，并遵循相应的法定程序。
- 若选择公司减资，需制定减资方案，经过股东会决议，并编制资产负债表及财产清单，通知债权人并公告，最后办理工商变更登记。
法律途径解决纠纷：
- 当协商、公司章程规定等方式无法解决撤资纠纷时，可向有管辖权的人民法院提起诉讼。
- 若股东间存在仲裁条款约定，也可将撤资纠纷提交给约定的仲裁机构进行仲裁。
二、股东纠纷案件撤诉后的处理
若股东纠纷案件已经进入诉讼或仲裁程序，但后续双方达成和解或一方决定撤诉，那么需要按照以下步骤进行处理：
提交撤诉申请：
- 若决定撤诉，需向受理案件的法院或仲裁机构提交书面撤诉申请，说明撤诉的理由和意愿。
法院或仲裁机构审查：
- 法院或仲裁机构会对撤诉申请进行审查，确认撤诉是否出于自愿，且不违反法律法规的强制性规定。
裁定撤诉或终结仲裁程序：
- 若审查通过，法院会作出裁定准许撤诉，仲裁机构则会终结仲裁程序。
后续事宜处理：
- 撤诉后，双方应按照和解协议或协商结果履行各自义务。
- 若撤诉后双方又产生新的纠纷，可再次通过协商、诉讼或仲裁等方式解决。
三、注意事项与建议
遵守法律法规：
- 在处理股东撤资纠纷及撤诉过程中，应严格遵守相关法律法规及公司章程规定，不得损害公司及其他股东的合法权益。
保留证据：
- 在整个过程中，应保留好相关证据，如公司章程、股东协议、财务报表、协商记录等，以备不时之需。
专业法律建议：
- 处理股东撤资纠纷及撤诉事宜时，建议咨询专业律师。律师可深入研究相关法律文件，了解公司具体情况，为当事人提供精准的法律建议与解决方案。
综上所述，股东纠纷案件撤诉后的处理需遵循法定程序，并确保双方权益得到妥善保护。在整个过程中，遵守法律法规、保留证据、寻求专业法律建议是关键所在。希望以上解答能对您有所帮助。