工程款财产保全既可以在起诉前进行，也可以在起诉后进行，但两者在操作程序和法律效果上存在一定差异。以下是对这两种情况的详细分析：
起诉前财产保全
法律依据：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，在提起诉讼或者申请仲裁前，因情况紧急，不立即申请保全将会使其合法权益受到难以弥补的损害的，利害关系人可以向被保全财产所在地、被申请人住所地或者对案件有管辖权的人民法院申请采取保全措施。
操作程序：
- 申请人需要向法院提交书面申请，并提供相关证据证明其合法权益可能受到难以弥补的损害。
- 法院在审查后，认为符合保全条件的，会裁定采取保全措施，并立即执行。
- 申请人需要在法院采取保全措施后三十日内依法提起诉讼或者申请仲裁，否则法院会解除保全。
法律效果：
- 起诉前财产保全能够迅速、有效地防止被申请人转移、隐匿或处分财产，确保将来判决的执行。
- 但同时，申请人也需要承担一定的风险，如果最终败诉或者未在规定期限内提起诉讼或仲裁，可能会因保全错误而承担赔偿责任。
起诉后财产保全
法律依据：
- 同样根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，人民法院对于可能因当事人一方的行为或者其他原因，使判决难以执行或者造成当事人其他损害的案件，根据对方当事人的申请，可以裁定对其财产进行保全、责令其作出一定行为或者禁止其作出一定行为。
操作程序：
- 在起诉后，当事人可以向受理案件的法院提交财产保全申请。
- 法院在审查后，认为符合保全条件的，会裁定采取保全措施。
- 与起诉前财产保全不同的是，起诉后财产保全不需要申请人在三十日内提起诉讼或仲裁，因为诉讼或仲裁已经在进行中。
法律效果：
- 起诉后财产保全同样能够确保判决的执行，防止被申请人转移、隐匿或处分财产。
- 但相对于起诉前财产保全，其紧迫性可能稍低，因为诉讼或仲裁已经在进行中，法院有更多的时间和手段来保障当事人的权益。
综合建议
- 选择起诉前还是起诉后财产保全：这取决于具体情况和当事人的需求。如果情况紧急，担心被申请人会迅速转移财产，那么起诉前财产保全可能更为合适。如果诉讼或仲裁已经在进行中，且担心被申请人会在此期间处分财产，那么起诉后财产保全可能更为稳妥。
- 注意事项：无论是起诉前还是起诉后财产保全，都需要提供充分的证据证明其合法权益可能受到难以弥补的损害。同时，申请人也需要承担一定的风险，如果保全错误或者未在规定期限内提起诉讼或仲裁，可能会承担赔偿责任。
如有关于工程款财产保全或其他法律问题的疑问，可以直接向我咨询。我会根据你的具体情况，提供专业的法律建议和帮助。