核心结论：开荒地使用超过5年，其处理方式需结合土地性质、是否取得合法使用权、地方政策及实际使用情况综合判断，可能涉及继续使用、补办手续、返还土地或承担法律责任等情形。以下分情况说明：

1. 若开荒地属于集体所有且未取得合法使用权

• 法律后果：根据《土地管理法》第四十条及第七十七条，开垦未利用土地需经依法批准，未经批准擅自开垦的，可能面临责令退还土地、限期拆除或没收地上附着物等处罚。
• 处理建议：
  • 立即停止使用：若未取得合法手续，建议停止开垦行为，避免扩大损失。
  • 补办审批手续：向当地自然资源部门申请开垦许可，符合条件的可补办手续后合法使用。
  • 协商处理：与土地所有权人（如村集体）协商，通过承包、租赁等方式取得合法使用权。

2. 若开荒地属于国有未利用地且未取得合法使用权

• 法律后果：根据《土地管理法》第五十一条，开垦国有未利用地需经县级以上政府批准，未经批准的，可能面临行政处罚或土地收回。
• 处理建议：
  • 申请国有土地使用权：向自然资源部门提交开垦申请，经批准后办理土地登记，取得合法使用权。
  • 配合调查：若已被相关部门查处，应积极配合调查，主动说明情况，争取从轻处理。

3. 若已通过合法程序取得开荒地使用权

• 法律后果：根据《农村土地承包法》或相关合同约定，合法取得的使用权受法律保护，超过5年不影响权利效力。
• 处理建议：
  • 续期或确权：若承包期或租赁期即将届满，可提前申请续期或办理确权登记，巩固权利。
  • 规范使用：按照合同约定或法律规定用途使用土地，避免改变用途导致违约或违法。

4. 若开荒地涉及生态保护或特殊用途

• 法律后果：根据《环境保护法》《森林法》等，若开垦行为破坏生态（如湿地、林地），可能面临行政处罚甚至刑事责任。
• 处理建议：
  • 生态修复：立即停止破坏行为，采取补种、复垦等措施修复生态。
  • 申请变更用途：若需继续使用，需向相关部门申请变更土地用途，经批准后方可实施。

5. 地方政策差异的特别提示

• 政策影响：部分地区对开荒地有特殊规定（如“四荒地”拍卖、承包优先权等），需结合当地政策处理。
• 操作建议：
  • 咨询当地部门：向乡镇政府或自然资源部门了解具体政策，确保操作合规。
  • 保留证据：保存开垦投入、使用年限等证据，以备争议时主张权利。

总结：开荒地使用超过5年的处理需以合法性为核心，优先确认土地性质及使用权状态。若未取得合法手续，建议尽快补办或协商解决；若已合法取得，则需规范使用并关注续期问题。涉及生态或特殊用途的，需严格遵守相关法律，避免法律风险。如有具体案件或地方政策疑问，可进一步提供细节，我将结合实际情况为您分析。