非法集资债权转让协议在大多数情况下是不合法的，但具体还需根据实际情况判断。以下是对该问题的详细分析：
一、非法集资与债权基础瑕疵
非法集资行为本身具有违法性，它未经有关部门依法批准，或借用合法经营的形式吸收资金，通过公开宣传并承诺在一定期限内还本付息或给付回报，向社会不特定对象吸收资金。这种违法行为产生的债权，其根源建立在非法活动之上，因此存在基础瑕疵，难以获得法律的有效承认和支持。这意味着，基于非法集资产生的债权转让，在大多数情况下是不合法的。
二、债权转让的合法性判断
债权本身的合法性：
- 债权转让的合法性首要取决于债权本身的合法性。如果债权本身是合法的，即不存在与非法集资相关的违法行为（如超高利息、欺诈等），那么债权转让在法律上通常是可行的。
- 此时，只需按照民事法律关于债权转让的规定，如通知债务人、不存在禁止转让的约定等，即可完成合法的债权转让。
非法集资背景下的特殊考量：
- 在非法集资的背景下，债权转让的合法性变得复杂。非法集资往往涉及众多被害人以及复杂的经济关系，将非法集资形成的债权随意转让，可能会打乱对非法集资案件的统一处置和追赃挽损工作安排。
- 这种情况下，即使债权本身看似合法，其转让也可能因违反相关法律法规（如可能损害国家、集体以及其他合法债权人的利益）而被认定为非法。
特殊情况下的合法性：
- 存在一些特殊情况，当非法集资案件已得到妥善处理，相关债权经过合法的清理和确认程序，并且转让行为完全符合民事法律关于债权转让的规定时，这种情况下的债权转让有可能被认定为合法。
- 但这种情况在非法集资背景下相对少见，且需要严格的法律程序和审查。
三、法律建议与风险提示
- 审查债权合法性：在进行债权转让前，务必仔细审查债权的合法性，避免涉及非法集资等违法行为。
- 咨询专业意见：由于非法集资案件的复杂性，建议在进行债权转让前咨询专业律师（即向我咨询），以确保转让行为的合法性并降低法律风险。
- 注意法律后果：如果债权转让被认定为非法，可能会面临转让无效、被追缴违法所得等法律后果，甚至可能涉及刑事责任。
总结来说，非法集资债权转让协议的合法性需根据具体情况进行判断。在大多数情况下，由于非法集资行为的违法性，其产生的债权转让是不合法的。因此，在进行债权转让前，请务必谨慎审查并咨询专业意见。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。