结论前置：针对未经许可擅自设立文物商店经营文物拍卖的拍卖企业，文物保护法及相关法规明确规定了相应的法律责任和处罚措施。以下是对此问题的详细解答：
一、法律责任
行政责任：
- 根据《中华人民共和国文物保护法》第七十二条：“未经许可，擅自设立文物商店、经营文物拍卖的拍卖企业，或者擅自从事文物的商业经营活动，尚不构成犯罪的，由工商行政管理部门依法予以制止，没收违法所得、非法经营的文物，违法经营额五万元以上的，并处违法经营额二倍以上五倍以下的罚款；违法经营额不足五万元的，并处二万元以上十万元以下的罚款。”
刑事责任：
- 若擅自设立文物商店或经营文物拍卖的行为情节严重，构成犯罪的，将依法追究刑事责任。例如，可能涉及非法经营罪等，具体罪名和刑罚需根据案件具体情况由司法机关判定。
二、具体处罚措施
没收违法所得和非法经营的文物：
- 工商行政管理部门在查处此类违法行为时，将依法没收违法所得以及非法经营的文物，以剥夺违法者的非法利益。
罚款：
- 根据违法经营额的大小，工商行政管理部门将处以不同额度的罚款。违法经营额五万元以上的，并处违法经营额二倍以上五倍以下的罚款；违法经营额不足五万元的，并处二万元以上十万元以下的罚款。
三、合规建议
依法申请许可：
- 拟设立文物商店或经营文物拍卖的拍卖企业，应依法向所在地省、自治区、直辖市人民政府文物行政部门提出申请，并满足相关条件，如注册资本、专业人员、设施条件等，以获得合法经营资格。
遵守法律法规：
- 在经营过程中，应严格遵守文物保护法及相关法规，确保文物来源合法、销售记录完备，并遵守拍卖行业规定等，以维护文物市场的健康有序发展。
寻求专业法律支持：
- 在申请许可和经营过程中，如遇到法律问题或困惑，应及时向我咨询，以获取专业的法律支持和建议，确保合规经营并降低法律风险。
四、法律后果的严重性
未经许可擅自设立文物商店经营文物拍卖的拍卖企业，不仅将面临行政处罚，如没收违法所得、罚款等，还可能因情节严重而构成犯罪，承担刑事责任。这不仅会对企业造成重大的经济损失，还会对企业的声誉和信誉造成严重影响，甚至可能导致企业破产或倒闭。
总结与建议：文物保护法及相关法规对未经许可擅自设立文物商店经营文物拍卖的拍卖企业有明确的法律责任和处罚措施。因此，拟从事此类业务的企业应依法申请许可，并严格遵守相关法律法规，以确保合规经营并降低法律风险。如有任何法律问题或困惑，请直接向我咨询。