投资款未用完的处理方式需根据投资协议约定、公司章程规定及实际经营需求综合判断，常见处理路径如下：

1. 按协议约定处理
   若投资协议中明确约定了未使用投资款的处置方式（如返还投资者、转为后续投资款、留存公司作为资本公积等），应优先按协议执行。例如：

   • 协议约定“未使用部分需在X日内返还投资者”，则公司需按期返还，否则可能构成违约；
     
   • 协议约定“可留存公司用于未来项目”，则需履行内部决策程序（如股东会决议）后留存。
     提示：需核查协议条款是否合法有效（如是否违反强制性规定、是否损害其他股东权益等）。

2. 公司内部决策程序
   若协议无明确约定，需根据公司章程或《公司法》规定处理：

   • 有限责任公司：需经股东会或董事会决议，决定未使用款项的用途（如增资、分红、偿还债务等）；
     
   • 股份有限公司：需按章程规定的程序（如董事会提案、股东大会审议）决策。
     关键点：决策程序需符合法定或章程要求的表决权比例（如代表三分之二以上表决权的股东通过）。

3. 返还投资者的合法性审查
   若需返还投资者，需注意：

   • 减资程序：若返还导致公司注册资本减少，需按《公司法》第177条履行减资程序（编制资产负债表、通知债权人、公告等），否则可能面临行政处罚或债权人追责；
     
   • 税务合规：返还投资款可能涉及企业所得税或个人所得税问题，需提前与税务机关沟通确认；
     
   • 其他股东权益：若返还损害其他股东优先购买权或同等条件下的投资权，可能引发纠纷。

4. 转为其他用途的合规性
   若将未使用款项用于协议约定外的项目（如从股权投资转为债权投资），需：

   • 取得投资者书面同意；
     
   • 修改公司章程或投资协议；
     
   • 履行相关审批或备案程序（如涉及外资、金融业务等需主管部门批准）。

建议行动步骤：

1. 核查投资协议、公司章程及内部决策文件；
   
2. 评估未使用款项的金额、性质及公司当前需求；
   
3. 根据评估结果选择处理方式，并履行必要程序；
   
4. 保留所有决策文件、沟通记录及财务凭证，以备后续审计或纠纷。
   

若有具体协议条款或公司类型需进一步分析，可直接向我提供细节，我会结合实务经验为您细化方案。