农村经济联合社，在法律上通常被称为农民专业合作社联合社，其登记注册主要依据的是《中华人民共和国农民专业合作社法》以及《市场主体登记管理条例》。

首先，根据《中华人民共和国农民专业合作社法》第五十七条明确规定，农民专业合作社联合社需要依照本法进行登记，取得法人资格，并领取营业执照，其登记类型为农民专业合作社联合社。这一法律条款为农村经济联合社的登记注册提供了直接的法律基础。

其次，《市场主体登记管理条例》也进一步明确了市场主体（包括农民专业合作社联合社）的登记管理要求。该条例规定，市场主体应当依照本条例办理登记，未经登记不得以市场主体名义从事经营活动。这同样适用于农村经济联合社，它们必须按照条例规定进行设立登记、变更登记和注销登记等。

在具体登记注册过程中，农村经济联合社需要满足一定的条件，如具有民事行为能力的公民、企业、事业单位或社会组织等可以成为其成员，且农民成员至少应占成员总数的百分之八十；需要有符合法律规定的章程、组织机构、名称和住所；以及有符合章程规定的成员出资等。同时，它们还需要向有登记权限的登记机关提交一系列文件，如登记申请书、设立大会纪要、章程、法定代表人及理事的任职文件和身份证明、出资清单、成员名册和成员主体资格文件等。

综上所述，农村经济联合社的登记注册主要依据的是《中华人民共和国农民专业合作社法》和《市场主体登记管理条例》这两部法律法规。在登记注册过程中，它们需要满足一定的条件，并提交相应的文件以完成登记手续。