结论：电动自行车车祸肇事逃逸后，保险公司是否赔偿需分情况讨论，主要取决于保险类型、保险条款约定以及逃逸行为的法律定性。以下是具体分析：

1. 若投保的是交强险（机动车交通事故责任强制保险）
   根据《机动车交通事故责任强制保险条例》第22条，若肇事逃逸属于“被保险人故意制造道路交通事故”的情形，保险公司仅对抢救费用承担垫付责任，并有权向致害人追偿，对财产损失不承担赔偿责任。但需注意：

   • 司法实践中，单纯逃逸行为通常不被认定为“故意制造事故”，除非逃逸导致事故责任无法认定或扩大损害后果（如未及时救助导致伤者死亡）。
     
   • 若逃逸未影响事故责任认定，且无其他免责情形（如无证驾驶、酒驾等），交强险仍需在限额内赔偿人身损害（如医疗费、伤残赔偿金），但财产损失（如车辆维修费）可能免赔。

2. 若投保的是商业三者险（第三者责任保险）
   商业险的赔偿以保险合同约定为准。多数商业险条款将“肇事逃逸”列为免责条款，即保险公司有权拒赔。但需满足以下条件：

   • 保险公司已对免责条款履行明确说明义务（如投保时签字确认、加粗提示等）；
     
   • 逃逸行为与事故损失存在因果关系（如因逃逸导致无法确定损失范围或加重损害）。
     例外情形：若保险公司未尽到说明义务，或逃逸行为与损失无因果关系（如事故本身已造成车辆损毁，逃逸未扩大损失），法院可能支持赔偿请求。

3. 若未投保或保险拒赔
   肇事者需自行承担全部赔偿责任，包括对方的人身损害和财产损失。若逃逸构成交通肇事罪（如致人重伤、死亡或重大财产损失），还可能面临刑事处罚。

建议：

• 立即报警并配合调查，明确事故责任；
  
• 保留医疗记录、维修发票等证据；
  
• 若保险公司拒赔，可要求其出具书面拒赔通知，并核对保险条款及说明义务履行情况；
  
• 如有争议，可向法院起诉，由法院根据具体证据和法律判定赔偿责任。
  

如有进一步细节（如是否投保、逃逸是否影响责任认定等），可继续向我咨询，我会结合具体情形为您分析。