结论前置：
- “旷工一天扣三天工资”的做法通常不合法，它违反了《中华人民共和国劳动法》中关于工资支付的相关规定。
- 直接的法律条文依据主要是《劳动法》第五十条，该条款明确规定了工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
详细分析：
法律依据
- 《中华人民共和国劳动法》第五十条：这是判断扣罚工资行为合法性的基本法律框架。它明确规定了工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，且不得克扣或者无故拖欠。这意味着，用人单位必须按照约定支付劳动报酬，任何扣款行为都需有法定依据。
- 《工资支付暂行规定》第十六条：该条款指出，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失，且经济损失的赔偿可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。这一条款仅允许在特定情形下有限度扣款，且未授权“旷一罚三”的惩罚性扣款。
合理性分析
- 违反比例原则：旷工行为与三倍工资的处罚明显失衡。例如，某员工日薪300元，旷工一天被扣900元，这种远超实际损失的处罚既不合理也不公平。
- 涉嫌变相罚款：根据《行政处罚法》，罚款权专属于行政机关。企业自行设定高额扣款实质构成非法罚款，可能引发劳动纠纷。
- 损害劳动关系：过度扣款会激化劳资矛盾，降低员工归属感。采用合理考勤制度的企业员工流失率通常比实施惩罚性扣款的企业低。
企业正确处理方式
- 完善规章制度：企业应通过民主程序制定《员工手册》，明确旷工的认定标准和处分梯度，如首次警告、二次扣发当日工资、三次解除劳动合同等。
- 规范扣款流程：扣款前须履行告知义务，出具书面通知并说明事由。扣款金额不得超过当月工资的20%，且不得低于最低工资标准。
- 建立申诉机制：企业应设立劳动争议调解委员会，对扣款异议进行公正裁决，保障员工救济权利。
法律建议：
- 对于劳动者：如果遇到用人单位以旷工为由扣三天工资的情况，应先查看用人单位的规章制度或劳动合同中是否有相关规定，并评估其合法性。如果认为自身权益受到侵害，可以与用人单位协商解决；协商不成时，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
- 对于用人单位：在制定规章制度或劳动合同时，应确保相关规定符合法律法规的要求，避免侵犯劳动者的合法权益。同时，在执行过程中也要严格遵守相关规定，确保公平、公正地对待每一位劳动者。
可能后果：
- 如果用人单位违法扣罚工资，可能面临劳动保障行政部门的责令限期支付、加付赔偿金等处罚。
- 劳动者也可能因此解除劳动合同，并要求用人单位支付经济补偿金。
希望以上分析能帮助你更好地理解这一问题，并为你提供实用的法律建议。如果你还有其他关于劳动工伤或工资福利方面的问题，欢迎直接向我咨询。