在取保候审期间，手机被扣押后是否一定会被查，这并非一个绝对的问题，而是取决于手机与案件的具体关联情况。以下是对此问题的详细分析：
一、手机与案件无关的情况
及时退还与检查可能性低：
- 如果手机经查明与案件没有直接关联，既不是犯罪工具，也不包含与案件相关的证据，那么侦查机关应当在确认无误后的三日以内通知被取保候审人领取被扣押的手机。在此情况下，手机被检查的可能性极低，因为已经确认其与案件无关。
保障权益与沟通：
- 被取保候审人有权要求侦查机关出具相应的扣押清单，并依据清单核对被扣押物品，确保自身合法权益不受侵害。同时，可以主动与办案机关沟通，了解手机被扣押的具体原因及后续处理情况。
二、手机与案件有关的情况
作为证据使用与检查必要性：
- 如果手机中存储有与案件直接相关的证据，如犯罪过程的记录、通信记录等，侦查机关有权将其作为证据进行扣押，并在整个诉讼过程中保存和使用。在此情况下，手机被检查是必然的，因为需要提取其中的证据以支持案件的侦查和审理。
归还时机与检查结束：
- 只有在案件审理结束，且司法机关认为不再需要该手机作为证据时，才会考虑将其归还给被取保候审人。这意味着，在手机作为证据使用期间，它可能会被多次检查以提取和确认相关证据。
属于犯罪工具与没收处理：
- 若手机被认定为实施犯罪的工具，如用于联络犯罪活动、策划犯罪计划等，侦查机关将依据法律规定对其进行没收处理。在这种情况下，手机不仅会被检查以确认其犯罪用途，而且通常不会归还给被取保候审人。
三、手机检查的法定程序与权益保障
法定程序：
- 司法机关在进行手机检查时，必须严格遵循法定程序，包括出示合法的检查手续和证件、明确告知被取保候审人检查的目的、范围和方式等。这确保了检查的合法性和正当性。
权益保障：
- 被取保候审人在手机被扣押和检查过程中，享有一系列的权益保障措施。如可以要求侦查机关出具扣押清单、了解扣押和检查的具体原因及后续处理情况、在认为手机与案件无关时提出申诉等。
四、建议与应对
遵守规定与配合调查：
- 被取保候审人应严格遵守取保候审期间的相关规定和限制，积极配合侦查机关的工作。这有助于加快案件的侦查和审理进程，同时也有助于保护自己的合法权益。
如实陈述与提供线索：
- 如实陈述案情，提供线索，以便尽快查清案件事实。这有助于减少不必要的手机检查和其他调查措施，从而保护自己的隐私和权益。
法律咨询与权益维护：
- 如果面临手机检查或其他相关问题，建议及时向我咨询以获取更准确的法律意见和帮助。作为专业律师，我可以根据具体情况提供针对性的法律建议和权益维护方案。
总结来说，取保候审期间手机被扣押后是否会被查，取决于手机与案件的具体关联情况。如果手机与案件无关，则被检查的可能性极低；如果手机与案件有关，则可能会被多次检查以提取和确认相关证据。在此过程中，被取保候审人应严格遵守相关规定和限制，积极配合侦查机关的工作，并在必要时寻求专业法律帮助以维护自己的合法权益。