核心结论：在欠信用社贷款已还但缺乏还款证据的情况下，可通过收集间接证据、与信用社协商、申请调解或提起诉讼等方式来维护自身权益。以下是具体分析：

1. 收集间接证据：

   • 银行流水记录：首先，尝试从自己的银行账户中查找与还款相关的交易记录。如果还款是通过银行转账进行的，那么银行流水将是最直接的证据。即使转账时未备注还款信息，转账的时间、金额等也能与贷款合同中的还款计划相印证。
   • 通信记录：检查与信用社工作人员的通信记录，包括短信、邮件、微信等。如果在还款前后与信用社有过沟通，并且沟通内容中涉及还款事宜，这些通信记录也可以作为辅助证据。
   • 证人证言：如果有第三方见证了还款过程，比如家人、朋友或同事，他们的证言也可以在一定程度上证明还款事实。
   • 其他相关证据：如还款时的收据、信用社的还款确认函（如果有的话）、还款时的照片或视频等，都可以作为证据来支持你的主张。

2. 与信用社协商：

   • 在收集到一定证据后，可以主动与信用社联系，说明还款情况，并提供所收集的证据。信用社在核实情况后，可能会出具还款确认书或更新你的还款记录。
   • 如果信用社拒绝承认还款事实，可以要求信用社提供其内部的还款记录或相关证据，以进行比对和核实。

3. 申请调解：

   • 如果与信用社协商无果，可以考虑向当地的金融调解机构或消费者权益保护组织申请调解。这些机构通常具有中立性和专业性，能够帮助双方达成和解。

4. 提起诉讼：

   • 如果调解也无法解决问题，最后的选择是向法院提起诉讼。在诉讼过程中，你需要提供所收集的证据来证明还款事实，并请求法院判决信用社确认还款并消除不良记录。
   • 需要注意的是，提起诉讼需要一定的时间和成本，因此在决定诉讼前应充分评估利弊。

行动建议：

• 尽快开始收集证据，特别是银行流水记录和通信记录，这些证据随着时间的推移可能会变得难以获取。
• 在与信用社协商时，保持冷静和理性，避免情绪化的交流，以更好地解决问题。
• 如果对法律程序不熟悉，可以考虑咨询或聘请一位有经验的律师来协助你处理此事。

在整个过程中，务必保持耐心和积极配合的态度，相信通过合理合法的途径，你能够维护自己的合法权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。