针对您提出的“在直行车上掉头怎么处罚，但掉头灯是红灯怎么办”的问题，我将结合相关交通法规和实际情况，为您详细解答。
一、直行车道掉头且红灯亮起的处罚情况
在直行车道掉头，并且掉头灯（或交通信号灯）为红灯时，这种行为明确违反了交通信号灯指示，属于严重的交通违法行为。根据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关实施条例，您将面临以下处罚：
闯红灯处罚：依据相关法规，闯红灯的行为一次记6分，并处20元以上200元以下罚款。
不按导向车道行驶处罚：同时，由于您在直行车道进行了掉头操作，这也违反了不按导向车道行驶的规定。在普通道路上，这可能面临罚款100-200元（不同地区处罚标准略有差异），并可能依据《道路交通安全违法行为记分管理办法》记3分。但需要注意的是，如果闯红灯的处罚已经涵盖了不按导向车道行驶的违规行为，则可能不会重复记分。
二、特殊情况说明
禁止掉头标志：如果路口设有明确的禁止掉头标志或标线，无论信号灯状态如何，均不允许掉头。违反者将被认定为“违反禁令标志指示”，通常会扣1分，并处20元以上200元以下罚款。
掉头缺口或信号灯：若路口设有专门的掉头缺口或掉头信号灯，则需遵循这些明确的交通标志或信号指示进行掉头操作。在掉头信号灯为绿灯时，可以合法掉头；若为红灯，则禁止掉头。
停止线后的单或双黄线：如果停止线后的单或双黄线为虚线，且没有禁止掉头的标志，红灯时掉头可能不被视为闯红灯（但需确保不影响其他车辆和行人通行）；若为实线，则严格禁止掉头。
三、安全驾驶建议
为了避免不必要的处罚和确保交通安全，我建议您：
严格遵守交通规则：特别是交通信号灯和交通标志的指示，不要随意在直行车道掉头或闯红灯。
观察路况和交通标志：在掉头前，仔细观察路况和交通标志，确保掉头行为合法且安全。
选择合适的掉头地点和时机：在允许掉头的地点和时机进行掉头操作，并确保不影响其他车辆和行人的正常通行。
综上所述，直行车道掉头且红灯亮起是明确的交通违法行为，将面临严厉的法律处罚。为了您和他人的安全，请务必严格遵守交通规则，确保行车安全。