公司破产时，法人的农村房是否会被执行，需根据具体情况判断，主要取决于该房产是否属于公司财产或法人个人财产，以及是否可用于清偿公司债务。以下从不同角度进行分析：
一、房产性质与归属
公司财产：
- 如果农村房是公司以法人名义购买，但实际为公司所有（例如，购房款由公司支付，房产用于公司经营等），且相关证据充分，那么该房产可能被视为公司财产。在公司破产时，该房产有可能被纳入破产财产范围，用于清偿公司债务。
法人个人财产：
- 如果农村房是法人个人所有，且购房款来源于法人个人资金，与公司无关，那么该房产属于法人个人财产。在公司破产时，一般情况下，法人个人财产不会被直接用于清偿公司债务。但是，如果法人存在滥用公司法人独立地位和股东有限责任，逃避债务，严重损害公司债权人利益的行为，根据《中华人民共和国公司法》的相关规定，债权人可以请求法院否认公司法人独立地位和股东有限责任，要求法人对公司债务承担连带责任。在这种情况下，法人个人财产（包括农村房）可能面临被执行的风险。
二、执行程序与限制
执行程序：
- 如果房产被确定为公司财产或法人需对公司债务承担连带责任，那么债权人可以向法院申请强制执行该房产。法院将依法进行评估、拍卖等程序，以清偿公司债务。
执行限制：
- 即使房产被确定为可执行财产，执行过程中也可能受到一定限制。例如，如果房产是法人的唯一住房，且符合当地规定的唯一住房保护条件，法院可能不会直接执行该房产。此外，执行过程中还需考虑房产的权属状况、是否存在抵押或查封等情况。
三、特殊情况与建议
特殊情况：
- 如果法人将农村房无偿或低价转让给第三方，以逃避债务，债权人可以依据《中华人民共和国民法典》的相关规定，请求法院撤销该转让行为，并恢复房产的原状，以便执行。
建议：
- 对于公司法人而言，应合理规划公司财产与个人财产，避免混同。在公司经营过程中，应遵守法律法规，诚信经营，避免滥用公司法人独立地位和股东有限责任。
- 对于债权人而言，在申请执行前应充分了解债务人的财产状况，包括农村房等不动产的权属情况。在执行过程中，应积极配合法院的工作，提供必要的证据和信息，以便顺利执行债务人的财产。
总结来说，公司破产时法人的农村房是否会被执行，需根据房产性质与归属、执行程序与限制以及特殊情况等因素综合判断。如有具体法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。