结论概述：超过退休年龄后仍在单位工作，是否应支付经济补偿金，这主要取决于劳动者与用人单位之间的法律关系性质以及具体情形。一般来说，如果双方形成的是劳务关系而非劳动关系，则通常不适用劳动法中关于经济补偿金的规定；但如果存在特定情形，如单位违法解除合同等，仍可能涉及经济赔偿。
详细分析：
法律关系性质：
- 劳动关系与劳务关系的区别：根据我国相关法律规定，劳动者达到法定退休年龄后，与用人单位之间的法律关系可能由劳动关系转变为劳务关系。劳动关系受《劳动法》、《劳动合同法》等法律法规调整，而劳务关系则主要受《民法典》等民事法律调整。
- 经济补偿金的适用：在劳动关系中，如果用人单位依法解除或终止劳动合同，且符合支付经济补偿金的条件（如用人单位提出并与劳动者协商一致解除劳动合同、用人单位因经济性裁员等），则应当向劳动者支付经济补偿金。然而，在劳务关系中，由于双方地位平等，通常不适用劳动法中关于经济补偿金的规定。
具体情形分析：
- 正常终止劳务关系：如果劳动者超过退休年龄后继续在单位工作，双方形成的是劳务关系，且劳务合同正常到期或双方协商一致终止，那么单位通常无需支付经济补偿金。
- 单位违法解除合同：尽管双方形成的是劳务关系，但如果单位存在违法解除合同的行为（如无正当理由单方面解除合同），劳动者仍有权要求单位承担相应的法律责任，包括可能的赔偿。但这种情况下，赔偿的依据和标准将依据民事法律而非劳动法来确定。
- 特殊情形下的经济补偿：在某些特殊情况下，即使双方形成的是劳务关系，也可能因特定政策或地方性法规的规定而涉及经济补偿。例如，某些地区可能对于超过退休年龄但仍继续工作的劳动者有特殊的保护政策。
法律建议：
- 明确法律关系：首先，劳动者和用人单位应明确双方之间的法律关系性质，是劳动关系还是劳务关系。这有助于确定双方的权利和义务，以及可能涉及的法律责任。
- 签订书面合同：无论双方形成的是劳动关系还是劳务关系，都建议签订书面合同，明确双方的权利和义务、工作内容、报酬支付方式、合同期限等关键条款。这有助于在发生争议时提供有力的证据支持。
- 咨询专业律师：由于法律问题的复杂性和多样性，建议劳动者和用人单位在涉及经济补偿金等法律问题时咨询专业律师。律师可以根据具体情况提供针对性的法律建议和解决方案。
可能后果：
- 如果双方形成的是劳务关系且合同正常终止，单位无需支付经济补偿金，但应确保合同终止的合法性和合理性，避免引发不必要的法律纠纷。
- 如果单位存在违法解除合同的行为，劳动者有权要求单位承担相应的法律责任，包括可能的赔偿。单位应谨慎处理合同解除事宜，确保符合法律法规的规定。
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