企业申请行政复议的期限一般为六十日，但特定情况下可延长至九十日。以下是对这一问题的详细分析：

一、一般期限

根据《中华人民共和国行政复议法》的相关规定，企业认为具体行政行为侵犯其合法权益的，可以自知道该具体行政行为之日起六十日内提出行政复议申请。这是企业申请行政复议的一般期限。

二、特殊情况下的期限延长

1. 法律规定的申请期限超过六十日的：如果其他法律规定的申请期限超过六十日，那么企业应按照该更长的期限来申请行政复议。例如，某些特定类型的行政行为可能有更长的复议申请期限。

2. 因不可抗力或其他正当理由耽误申请期限的：如果企业因不可抗力（如自然灾害、战争等）或其他正当理由（如严重疾病、意外事件等）耽误了申请期限，那么在障碍消除后的十日内，企业可以申请延长期限，并且行政复议机关应当准许。但需要注意的是，这种延长并非无限制，且需要企业提供充分的证据来证明其耽误期限的合理性。

三、申请期限的计算

1. 起始点：申请期限的起始点为企业知道具体行政行为之日。这通常指的是企业收到行政机关作出的具体行政行为的书面通知或决定之日。

2. 终止点：申请期限的终止点为六十日（或延长后的期限）的最后一日。如果最后一日是法定节假日或休息日，那么申请期限将顺延至下一个工作日。

四、法律后果

1. 逾期申请：如果企业未在规定的期限内提出行政复议申请，那么行政复议机关将不予受理。这意味着企业将失去通过行政复议途径来维护自身合法权益的机会。

2. 及时申请：相反，如果企业及时在规定期限内提出了行政复议申请，那么行政复议机关将依法受理并审查该申请，从而为企业提供一个公正、透明的争议解决机制。

五、建议

1. 及时了解行政行为：企业应密切关注行政机关作出的具体行政行为，确保在第一时间了解并评估其对企业的影响。

2. 准备申请材料：一旦决定申请行政复议，企业应尽快准备相关的申请材料，包括行政复议申请书、证据材料等。

3. 咨询专业律师：在申请行政复议过程中，企业可能会遇到各种法律问题和挑战。因此，建议企业咨询专业律师以获取更全面、准确的法律建议和支持。

作为专注于拆迁安置、行政纠纷领域的律师，我深知行政复议对于企业维护自身合法权益的重要性。如果您在行政复议方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。