闯红灯被扣6分后，驾驶员可以通过以下几种合法途径来消除扣分记录：

1. 等待记分周期结束自然恢复

   • 规则说明：驾驶证的记分周期为12个月，从初次领证日期起算。若在一个记分周期内扣分未达到12分，并且已缴纳了所有罚款，那么记分周期结束时，所扣的分数会自动清零，驾驶证恢复到满分状态。例如，若驾驶证初次领证日期为5月1日，则每年5月1日0时记分额度恢复至12分。
   • 注意事项：已扣的6分不会提前消除，需等待完整记分周期结束。同时，务必确保罚款已交清，否则记分将转入下一个记分周期。

2. 通过交管12123APP在线处理违章并缴纳罚款

   • 操作步骤：
     1. 下载并注册交管12123APP账号（若未安装）。
     2. 登录后，在首页找到“违法处理”或相关选项，选择车牌号查看未处理的违章记录。
     3. 选中闯红灯记录，按照提示完成罚款缴纳。
     4. 处理后需等待一段时间，车辆状态恢复正常即表示扣分已消除。
   • 注意事项：在线处理违章需确保网络环境安全，避免个人信息泄露。同时，缴纳罚款后，务必确认违章记录已清除。

3. 参加交通安全学习与活动抵分（部分地区适用）

   • 学法减分：
     • 申请条件：持有效驾驶证的驾驶人，处理完交通违法且未被记满12分，可通过交管12123APP申请学法减分。
     • 操作方式：

          1. 完成网上学习（观看视频/文档）并考试合格，一次减1分。
          2. 现场学习（交通安全课）并考试合格，一次减2分。
          3. 公益活动（如文明交通劝导）满1小时，一次减1分。
       

     • 限制：每个记分周期最多减6分。
   • 参加交通安全公益活动：
     • 适用情况：取决于所在地区是否有相关政策。
     • 具体流程：通过参加文明交通劝导、交通安全宣传等公益活动，按一定时长和次数抵扣记分。需提前在当地交警部门指定平台或地点报名，活动结束后经审核即可抵分。

4. 特殊情况申请减免分数（极少数情况）

   • 适用情况：在极少数特殊情况下，如紧急避险导致的闯红灯，可向相关部门提出申请，尝试减免部分分数。
   • 注意事项：这需要充分的证据支持，并且过程可能较为复杂。建议驾驶员在申请前咨询当地交警部门或法律专业人士，了解具体申请流程和所需材料。

无论采取哪种方式处理闯红灯扣分记录，都应及时缴纳罚款并严格遵守交通规则。为避免类似情况再次发生，建议驾驶员加强交通安全意识，严格遵守交通信号灯指示。同时，不同地区的交通管理政策可能有所差异，具体的处理方法建议咨询当地的车辆管理所或交警部门以获取最准确的信息。若还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。