在处理公司员工因故意或重大过失给公司造成损失的情况时，确定案由主要涉及到对员工行为性质的认定以及相关法律责任的划分。以下是对这一问题的详细解答：
一、案由的确定原则
员工在工作中因故意或重大过失给公司造成损失，这一行为的案由通常可以归结为“侵权责任纠纷”或“劳动合同纠纷”，具体取决于损失的性质、员工的行为方式以及公司选择追究责任的法律途径。若员工行为构成对公司的直接侵权，如泄露商业机密、故意损坏公司财物等，则案由更倾向于“侵权责任纠纷”；若员工行为虽有过失，但主要是在履行劳动合同过程中发生的，且公司选择依据劳动合同法追究责任，则案由可能更倾向于“劳动合同纠纷”。
二、过错性质的认定
故意：
- 定义：员工明知自己的行为会导致公司损失，仍积极追求或放任这种结果的发生。
- 实例：如员工为谋取私利，故意泄露公司商业机密，导致公司遭受重大经济损失。
重大过失：
- 定义：员工在履行职责时，未尽到合理的注意义务，对可能发生的损失存在明显的疏忽或懈怠。
- 实例：如财务人员未仔细核对收款方信息，误将巨额款项转至错误账户，且未及时采取措施追回。
三、法律责任的划分
赔偿责任：
- 根据《中华人民共和国民法典》第一千一百九十一条，员工因故意或重大过失给公司造成损失的，应当承担赔偿责任。赔偿范围通常以公司实际损失为限，包括直接损失和间接损失。
- 赔偿方式可以先由公司与员工协商确定，协商不成的，公司可以通过法律途径（如仲裁或诉讼）要求赔偿。赔偿可以用员工的财产（如工资、奖金）进行，并可视情况分期偿还。
劳动合同解除：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，员工严重失职、营私舞弊给公司造成重大损害的，公司有权解除劳动合同，并要求经济赔偿。
四、特殊情况的考虑
职务行为：
- 如果员工在执行职务过程中为公司利益造成损失，且已尽到合理注意义务，公司可能需要承担部分责任。
公司管理责任：
- 如果公司因管理过错（如缺乏培训、内部监督机制不完善）导致员工失误造成损失，公司也应承担相应责任，并可适当减轻员工的赔偿责任。
五、预防与管理建议
为避免类似情况再次发生，公司应加强内部管理，完善规章制度，明确员工职责，提高员工责任意识和职业素养。同时，定期进行员工培训和考核，确保员工具备胜任工作的能力和素质。
六、实际操作中的注意事项
- 证据收集：公司应妥善保存与员工行为相关的证据，如监控录像、交易记录、电子邮件等，以便在追究责任时提供有力支持。
- 法律程序：公司在追究员工责任时，应遵循法律程序，确保赔偿责任的合理性和公正性。避免采取非法手段或过度追究责任，以免引发不必要的法律纠纷。
综上所述，确定公司员工因故意或重大过失给公司造成损失的案由，需要综合考虑过错性质、法律责任划分、特殊情况以及相关法律法规的规定。在实际操作中，公司应依法依规处理，并确保赔偿责任的合理性和公正性。