您好，关于摩托车闯红灯是否会被罚款并扣分的问题，我可以给您一个清晰且详细的解答。
首先，摩托车作为机动车，其驾驶员在行驶过程中必须严格遵守交通法规，包括交通信号灯的指示。闯红灯是一种严重的交通违法行为，不仅违反了交通法规，也极大地增加了发生交通事故的风险，对道路交通安全构成严重威胁。
针对您的问题，明确结论是：摩托车闯红灯不仅会被罚款，还会被扣分。具体来说，根据《道路交通安全违法行为记分管理办法》及最新修订的《机动车驾驶证申领和使用规定》，摩托车驾驶员若不按交通信号灯指示通行，将被一次记6分，并面临罚款处罚。通常情况下，罚款金额在20元以上200元以下，但很多地区对于摩托车闯红灯的罚款标准设定为200元，具体数额可能因地区和具体情况而有所差异，应以当地交警部门的处罚决定为准。
此外，闯红灯还可能带来其他严重后果：
民事赔偿责任：若因闯红灯引发交通事故，摩托车驾驶员需根据事故的具体情况承担相应的民事赔偿责任，包括赔偿受害人的医疗费用、财产损失等。
刑事责任：在严重情况下，如造成人员伤亡或重大财产损失，摩托车驾驶员可能构成交通肇事罪，需承担刑事责任，面临拘役、有期徒刑等刑罚。
准驾资格影响：多次闯红灯的驾驶员，其驾驶证的准驾资格可能会受到影响，甚至可能被吊销驾驶证。
处理流程方面：
一旦摩托车闯红灯被交警部门查获，驾驶员应及时到交警部门接受处理，缴纳罚款并接受扣分处罚。若驾驶员对处罚有异议，认为处罚不当或存在错误，有权申请行政复议或提起行政诉讼，通过法律途径维护自己的合法权益。
总结与建议：
摩托车闯红灯是一种极其危险且违法的行为，其法律后果严重且多样。作为驾驶员，应严格遵守交通规则，确保自身和他人的交通安全。同时，对于交警部门的处罚决定，应理性对待并及时处理。如有异议，应通过法律途径寻求解决。希望我的解答能够对您有所帮助，如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。