分公司被注销后，诉讼主体的确定需根据具体情况分析，一般可分以下两种情况处理：

1. 若分公司注销前已参与诉讼且未终结
   根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉的解释》第六十四条，企业法人解散的，依法清算并注销前，以该企业法人为当事人；未依法清算即被注销的，以该企业法人的股东、发起人或者出资人为当事人。
   若分公司注销时未完成清算程序（如未通知债权人、未清理债权债务），债权人可要求总公司的股东、发起人或出资人作为诉讼主体，承担清算责任或直接追偿。

2. 若分公司注销后新发生纠纷
   分公司不具有独立法人资格，其民事责任由总公司承担。因此，诉讼主体应为总公司。例如，分公司注销后，因合同履行、侵权等产生纠纷，原告应直接起诉总公司，由总公司参与诉讼并承担责任。

实务建议：

• 诉讼前需核查分公司注销时的清算程序是否合法（如是否公告债权人、是否留存清算报告）；
  
• 若总公司存在转移财产、逃避债务等情形，可申请追加总公司股东为共同被告；
  
• 涉及境外总公司的，需注意国际司法协助程序及法律适用问题。
  

如有具体案件细节（如注销时间、纠纷类型、清算程序等），可进一步向我说明，我会结合证据材料提供针对性分析。