结论：在交通事故中，非机动车承担主要责任而机动车承担次要责任时，非机动车确实需要按照责任比例赔偿机动车的修车费用。
一、责任划分与赔偿原则
责任划分：
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法》第七十六条的规定，机动车与非机动车驾驶人、行人之间发生交通事故，有证据证明非机动车驾驶人、行人有过错的，根据过错程度适当减轻机动车一方的赔偿责任。在您描述的情况下，非机动车承担主要责任，机动车承担次要责任，这意味着非机动车方需承担较大比例的赔偿责任，而机动车方则承担较小比例。
赔偿原则：
- 非机动车方需按照其过错程度赔偿机动车方的损失，这包括修车费用。赔偿比例通常根据事故责任认定书来确定，例如，如果非机动车被判定承担70%的责任，那么它就需要支付机动车修车费用的70%。
二、保险赔付顺序与个人承担
保险赔付顺序：
- 如果非机动车购买了相应的保险（如非机动车第三者责任险），可先由保险公司在保险限额内进行赔付。
- 机动车投保的交强险也将在其赔付范围内先行赔付机动车的修车费用，不足部分再由非机动车按照责任比例承担。
个人承担：
- 若非机动车未购买保险或保险赔付不足，剩余部分需由非机动车驾驶人个人承担。这意味着，即使非机动车方没有保险，也不能逃避赔偿责任，而是需要自行承担修车费用的相应比例。
三、实际操作建议
及时报警与报案：
- 发生交通事故后，应立即报警并联系保险公司。交警将出具事故认定书，明确事故责任；保险公司则根据事故认定书和保险条款进行理赔。
协商与调解：
- 对于非机动车一方来说，若需承担赔偿责任，应首先尝试与机动车一方进行友好协商。协商不成时，可寻求交警部门或人民调解委员会的帮助进行调解。这有助于双方达成和解，避免不必要的法律纠纷。
保留相关证据：
- 在处理交通事故过程中，应妥善保留所有相关证据，如事故现场照片、交警出具的事故认定书、维修费用发票等。这些证据在后续的赔偿协商或诉讼中将起到关键作用，有助于证明非机动车方的责任比例和赔偿金额。
四、特殊情况处理
- 如果事故发生时存在特殊情节影响责任认定或赔偿比例划分，或者机动车自身存在问题与事故损失存在争议等，这些特殊情况可能会使案件变得复杂。在这种情况下，建议非机动车方咨询专业律师，以便更好地了解自己的权利和义务，并制定合适的应对策略。
五、法律后果
- 如果非机动车方拒绝赔偿机动车方的修车费用，机动车方有权通过法律途径追究其责任。这可能导致非机动车方面临法律诉讼和相应的法律后果，如被判决支付赔偿金、承担诉讼费用等。
综上所述，非机动车在交通事故中承担主要责任时，确实需要按照责任比例赔偿机动车的修车费用。建议双方在处理事故时保持冷静、依法依规进行协商和处理，以避免不必要的法律纠纷和成本。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。