针对您提出的“交通部门执法别停违法车辆怎么处理”的问题，这实际上涉及到了两个层面的内容：一是交通部门如何执法别停违法车辆，二是别停行为本身（若为恶意或不当）可能面临的法律后果。不过，从您的提问语境来看，我理解您主要关注的是交通部门在执法过程中别停违法车辆这一行为的合法性及后续处理方式，同时我也将简要说明若别停行为不当可能面临的法律后果。
交通部门执法别停违法车辆
执法依据与程序：
- 交通部门在执法过程中，有权对违法车辆进行拦截和检查。这一行为通常基于《中华人民共和国道路交通安全法》等相关法律法规的授权。
- 执法人员在别停车辆时，应遵循严格的执法程序，包括出示执法证件、表明身份、说明拦截原因等，以确保执法行为的合法性和正当性。
别停方式与安全：
- 执法人员在别停车辆时，应采取安全、合理的方式，避免对违法车辆驾驶员、乘客或其他道路使用者造成不必要的危险或伤害。
- 在高速公路或城市快速路上等特殊场景下，执法人员应更加谨慎，确保别停行为不会引发交通事故或造成交通拥堵。
后续处理：
- 一旦违法车辆被成功别停，执法人员将依法对违法行为进行调查和处理，包括开具罚单、扣留车辆、吊销驾驶证等。
- 若违法行为构成犯罪，执法人员还将依法将案件移送司法机关处理。
若别停行为不当可能面临的法律后果
虽然您主要询问的是交通部门的执法行为，但我也简要说明一下，若别停行为本身（非执法行为）存在恶意或不当，可能面临的法律后果：
行政处罚：
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法》等相关法律法规，恶意别停车辆可能面临警告、罚款、扣分等行政处罚。
刑事处罚：
- 若恶意别停行为情节恶劣，如频繁别停、高速追逐等，可能构成危险驾驶罪或以危险方法危害公共安全罪，面临拘役、有期徒刑甚至死刑的严厉惩罚。
民事赔偿：
- 若恶意别停导致交通事故，造成人身伤害或财产损失的，别停行为人还需承担民事赔偿责任。
总结与建议
- 对于交通部门而言，在执法过程中别停违法车辆时，应严格遵守法律法规和执法程序，确保执法行为的合法性和正当性。
- 对于驾驶员而言，应自觉遵守交通规则，避免违法停车或其他违法行为的发生。若遇到交通部门执法别停车辆的情况，应积极配合执法人员的工作，接受调查和处理。
- 若您对交通部门的执法行为有疑问或异议，可以依法向相关部门提出申诉或投诉，以维护自己的合法权益。
希望以上解答能够对您有所帮助。如有其他问题或需要进一步的法律咨询，请随时告知。