组织卖淫罪中违法所得40万元的，一般会被判处五年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；若存在加重情节，则可能被判处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金或者没收财产。具体分析如下：

1. 基本量刑标准：

   • 根据《中华人民共和国刑法》第三百五十八条的规定，组织、强迫他人卖淫的，处五年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；情节严重的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金或者没收财产。
   • 违法所得40万元，通常会被视为情节严重的一个考量因素，但具体是否构成“情节严重”还需结合其他案件事实，如组织卖淫的人数、持续时间、对社会的影响等。不过，即便不构成“情节严重”，违法所得40万元也足以使犯罪嫌疑人面临五年以上十年以下有期徒刑的刑罚。

2. 加重情节的考量：

   • 如果组织卖淫行为中存在其他加重情节，如组织未成年人卖淫、强迫他人卖淫、造成被组织卖淫的人重伤、死亡或者其他严重后果的，那么刑罚将会更加严厉，可能被判处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金或者没收财产。

3. 量刑的个体化差异：

   • 在实际量刑过程中，法院会综合考虑犯罪嫌疑人的犯罪情节、认罪态度、悔罪表现、社会危害程度以及是否有立功、自首等法定从轻或减轻情节，来最终确定具体的刑罚。
   • 因此，即使违法所得相同，不同犯罪嫌疑人的最终刑罚也可能存在差异。

4. 罚金与没收财产：

   • 除了有期徒刑外，犯罪嫌疑人还可能被并处罚金或者没收财产。罚金的具体数额会根据违法所得的数额、犯罪情节以及犯罪嫌疑人的经济状况等因素来确定。
   • 如果犯罪嫌疑人的财产不足以支付罚金或者存在其他需要没收财产的情形，法院可能会决定没收其部分或全部财产。