核心结论：农村土地承包经营权证父子两本证合并为一本证，村长通常需要出具相关证明材料以协助办理合并手续，主要包括家庭成员关系证明、原承包经营权情况说明等，具体如下：

1. 家庭成员关系证明
   • 村长作为基层组织的负责人，对村内家庭情况较为熟悉。他需要出具能够证明父子关系的书面材料，比如加盖村委会公章的亲属关系证明，明确写明父子二人的姓名、身份证号以及父子关系等内容。这是为了确认两人确实属于同一家庭承包单位，符合土地承包经营权证合并的主体条件。因为土地承包经营权是以户为单位进行承包的，父子关系证明是认定他们属于同一承包户的重要依据。
   • 在一些情况下，如果户口本上已经明确体现了父子关系，村长出具的证明可以起到补充和确认的作用，尤其是在户口本信息可能存在不完整或需要进一步佐证的情况下。
2. 原承包经营权情况说明
   • 村长需要提供关于父子二人原各自承包经营权情况的说明。这包括原承包土地的面积、位置、四至界限（即土地的东、南、西、北四个方向的边界）等信息。这些信息对于准确合并土地承包经营权证至关重要，能够确保合并后的证书上所记载的土地信息准确无误。
   • 例如，如果父亲承包的土地位于村东，面积为 5 亩，儿子承包的土地位于村西，面积为 3 亩，村长需要在情况说明中详细记录这些内容，以便相关部门在合并时进行核对和登记。
   • 同时，村长还需要说明原承包经营权证的相关情况，如证书编号、颁发时间等，这有助于在办理合并手续时进行档案查询和核对，保证合并过程的合法性和规范性。

办理流程提示：在准备好村长出具的上述资料后，还需要携带父子二人的身份证原件及复印件、原土地承包经营权证原件等相关材料，前往当地的农村土地承包管理部门（通常是乡镇政府的农村经营管理部门或县级农业农村局）办理合并手续。在办理过程中，要按照工作人员的要求填写相关申请表格，确保信息的真实性和准确性。

注意事项：不同地区对于农村土地承包经营权证合并的具体要求和流程可能会有所差异，建议在办理前先向当地的农村土地承包管理部门咨询清楚，以免因材料不全或不符合要求而耽误办理进度。如果在办理过程中遇到任何法律问题，都可以直接向我咨询。