电瓶车在事故中被认定为全责时，确实需要依法对机动车的损失进行赔偿。以下是对此问题的详细分析：
一、赔偿的法律依据
根据《中华人民共和国道路交通安全法》第七十六条的规定，机动车与非机动车驾驶人、行人之间发生交通事故，非机动车驾驶人、行人有过错的，根据过错程度适当减轻机动车一方的赔偿责任；若非机动车驾驶人、行人负全责，则机动车一方的赔偿责任可以得到相应减轻，但并不意味着完全免除电瓶车方的赔偿责任。此外，《中华人民共和国民法典》第一千一百六十五条也明确规定，行为人因过错侵害他人民事权益造成损害的，应当承担侵权责任。这意味着，电瓶车方因过错导致事故发生，造成机动车损失，应当承担相应的赔偿责任。
二、赔偿的具体范围
财产损失赔偿：
- 主要包括机动车的维修费用。如果车辆因事故导致贬值，电瓶车方还需赔偿合理的贬值损失。
- 若机动车在维修期间，车主因无法正常使用车辆而产生替代性交通工具的合理费用，电瓶车方也需按责赔偿。
人身损害赔偿（如事故中机动车方人员受伤）：
- 涵盖医疗费、护理费、交通费、营养费、住院伙食补助费等治疗和康复所需的合理支出。
- 若造成残疾，还需赔偿辅助器具费和残疾赔偿金。
- 若导致死亡，则应赔偿丧葬费和死亡赔偿金。不过，在您提出的问题场景中，主要关注的是对机动车的财产损失赔偿，但了解人身损害赔偿的范围也是有益的，以防事故中出现人员受伤的情况。
三、赔偿方式与途径
保险理赔：
- 如果电瓶车方购买了第三者责任险等相关保险，应先由保险公司在保险责任限额范围内进行赔偿。超出保险限额的部分，则由电瓶车方自行承担。
双方协商：
- 双方可以就赔偿金额、方式和期限等进行协商，达成一致意见后签订协议并履行。这是解决赔偿问题最快捷高效的方式。
交警部门调解：
- 如果双方协商无果，可以请求交警部门进行调解。交警部门会根据事故情况、责任认定和法律法规提出调解意见，协助双方达成和解。
法律诉讼：
- 如果协商和调解都无法达成一致，或者电瓶车方拒绝履行赔偿责任，机动车方可以通过法律途径向法院提起诉讼。法院将依法审理并作出判决，强制电瓶车方履行赔偿责任。
四、注意事项与建议
及时报警与责任认定：
- 事故发生后，双方应及时报警并配合交警部门进行调查和责任认定。这是确定赔偿责任和后续处理的基础。
充分收集证据：
- 双方应尽可能收集现场照片、医疗记录、维修发票、收入证明等相关证据，以便在协商、调解或诉讼过程中使用。
了解保险条款：
- 如果涉及保险理赔，双方应仔细阅读保险合同条款，了解保险责任、免责条款和赔付流程等内容。
总结与建议：电瓶车在事故中被认定为全责时，必须依法对机动车的损失进行赔偿。双方应依法依规处理赔偿事宜，确保事故得到妥善解决。同时，也建议双方在事故发生后保持冷静和理性，通过合法途径维护自己的权益。如果您在处理此类事故时遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。