结论：大巴携带摩托车被交警查处，需根据具体违法情形接受相应处罚，可能涉及超限运输、非法改装、未按规定运输危险物品等不同情况，以下分情况说明处理方式及法律依据。

1. 若大巴属于普通客车，非法改装或超限运输摩托车

   • 违法情形：普通客车的设计用途是载客，若擅自拆除座椅、加装固定装置用于运输摩托车，属于非法改装车辆结构；若摩托车重量、尺寸超过客车核定载质量或外廓尺寸，则构成超限运输。
     
   • 法律依据：根据《道路交通安全法》第十六条，任何单位或个人不得擅自改变机动车已登记的结构、构造或特征；《公路安全保护条例》第三十三条规定，超过公路、公路桥梁、公路隧道限载、限高、限宽、限长标准的车辆，不得在公路上行驶。
     
   • 处理方式：交警会责令恢复原状（如拆除改装装置），并处以罚款（通常为200-2000元）；若超限运输，还需按超限比例补交公路补偿费，并可能被扣留车辆直至违法状态消除。

2. 若大巴属于营运客车，违规载货（含摩托车）

   • 违法情形：营运客车（如旅游大巴、长途客车）的行驶证核定用途为“公路客运”，若用于运输摩托车，属于“客货混装”或“擅自改变车辆使用性质”。
     
   • 法律依据：《道路运输条例》第三十条规定，客运经营者不得违反规定载货；《道路交通安全法》第四十九条规定，机动车载人不得超过核定人数，客运机动车不得违反规定载货。
     
   • 处理方式：交警会处以罚款（通常为500-2000元），并可能暂扣驾驶证；若涉及非法营运（如收取运费运输摩托车），交通运管部门可依据《道路运输条例》第六十三条，处以3万-10万元罚款。

3. 若摩托车属于易燃易爆物品（如改装为燃油助力车）且未按规定运输

   • 违法情形：若摩托车油箱容量超标、未排空燃油或未采取防火防爆措施，可能被认定为“危险物品”，而普通客车不具备运输危险物品的资质。
     
   • 法律依据：《危险化学品安全管理条例》第四十三条规定，危险物品运输需使用专用车辆，并配备安全防护设备；《道路交通安全法》第四十八条规定，机动车载运爆炸物品、易燃易爆化学物品等危险物品，需经公安机关批准并按指定时间、路线、速度行驶。
     
   • 处理方式：交警会扣留车辆及货物，处以罚款（通常为5万-10万元）；若造成严重后果（如泄漏、爆炸），还可能涉嫌危险物品肇事罪，承担刑事责任。

建议行动步骤：

1. 配合交警调查，如实说明摩托车来源、运输目的及是否收取费用；
   
2. 若对处罚有异议，可在收到处罚决定书后60日内申请行政复议，或6个月内提起行政诉讼；
   
3. 若涉及非法营运或危险物品运输，建议尽快委托律师介入，评估证据链完整性及法律风险。
   

温馨提示：运输摩托车应选择专用货车或平板拖车，并确保车辆手续齐全、装载合规；若需跨省运输，还需提前了解目的地省份的限行政策。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体场景下的法律应对方案。