结论：公司法定代表人有权管理和使用公司公章，但实际操作中，公司可根据自身情况通过内部规定确定公章的具体管理方式，并应建立完善的印章管理制度以确保公章的合法、安全使用。以下从法律规定和实践操作两个层面进行详细分析：
法律规定层面
法定代表人的职权：
- 根据《中华人民共和国民法典》第六十一条，法定代表人以法人名义从事的民事活动，其法律后果由法人承受。这表明法定代表人具有代表公司进行各类民事活动的广泛权利，包括管理和使用公章。公章作为公司对外进行法律行为的重要凭证，其管理和使用自然属于法定代表人职权的一部分。
- 同时，法人章程或者法人权力机构对法定代表人代表权的限制，不得对抗善意相对人。这意味着，除非公司内部有明确规定且该规定被外部相对人知晓，否则法定代表人使用公章的行为通常被视为公司行为，具有法律效力。
公司的自主决定权：
- 相关法律法规并未强制规定公章必须由法定代表人管理，而是允许公司通过公司章程或其他内部规定来明确公章的管理方式。这体现了公司在管理上的自治权，公司可以根据自身规模、业务特点和管理需求来制定合适的公章管理制度。
实践操作层面
法定代表人直接管理的情况：
- 在小型企业或初创公司中，由于组织结构简单、业务量少，为了提高效率，公章往往由法定代表人直接管理。这种情况下，法定代表人能够更直接地控制公章的使用，确保公司行为的合法性和有效性。
- 当公司股东和管理层对法定代表人高度信任时，也可能选择由其直接掌控公章，以保障公司运营的安全和利益。
非法定代表人管理的情况：
- 出于风险防控考虑，一些公司会设立专门的印章管理人员或部门（如行政部、财务部、法务部等）来负责公章的保管和使用。这种情况下，公章的使用需要经过严格的审批流程，以确保公章使用的规范性和程序性。
- 大型公司通常拥有复杂的治理结构，会制定详细的印章管理制度，明确公章的保管、使用流程和审批权限。这种制度化的管理方式有助于保证公章使用的合规性，降低因公章管理不善而引发的法律风险。
管理建议与法律责任
- 建立完善的印章管理制度：无论公章由谁管理，公司都应制定并执行严格的印章管理制度，明确公章的保管、使用、审批流程以及责任追究机制。这有助于确保公章的合法、安全使用，降低法律风险。
- 确保公章的安全、合规使用：法定代表人及负责管理公章的人员应严格遵守公司制度和相关法律法规，确保公章不被滥用或丢失。一旦发现公章被滥用或丢失，应立即采取措施防止损失扩大，并及时向相关部门报告。
- 承担法律责任：如果因公司内部印章管理不善导致公章被滥用或产生其他法律问题，公司法定代表人及相关责任人可能需要承担相应的法律后果。因此，加强印章管理、完善制度是至关重要的。
综上所述，虽然公司法定代表人有权管理和使用公章，但实际操作中需结合公司具体情况和内部管理需求来确定公章的管理方式，并建立完善的制度以确保公章的合法、安全使用。如果您在公司印章管理方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。