合作社将车辆卖给个人，可能涉及以下几个方面的法律后果，我将分情况为您详细说明：

1. 合同效力问题
   只要合作社与个人之间的车辆买卖合同符合《民法典》关于民事法律行为效力的规定（如双方具有完全民事行为能力、意思表示真实、不违反法律强制性规定或公序良俗），合同即具有法律效力。双方需按合同约定履行义务，如交付车辆、支付价款等。若合同存在瑕疵（如未明确车辆质量标准、付款方式等），可能引发纠纷，但不影响合同整体效力。

2. 税务合规问题

   • 增值税：合作社作为销售方，若车辆属于其固定资产且用于生产经营，销售时可能需按简易办法依3%征收率减按2%缴纳增值税（具体需根据车辆购入时间、用途及当地税务政策确定）。若合作社为小规模纳税人，可能享受免税或减税优惠。
     
   • 企业所得税/个人所得税：合作社销售车辆产生的收益需计入应纳税所得额，缴纳企业所得税；若合作社为个体工商户或个人独资企业，则需缴纳个人所得税。
     
   • 印花税：买卖合同需按“产权转移书据”税目缴纳印花税。
     建议：双方应在合同中明确税费承担方，并确保税务申报与缴纳符合规定，避免因税务问题被处罚。

3. 车辆过户与登记问题
   根据《机动车登记规定》，车辆所有权转移后，需在30日内办理过户登记。合作社作为原车主，有义务协助个人完成过户手续（如提供车辆登记证书、行驶证等）。若未及时过户，可能面临以下风险：

   • 合作社仍被视为车辆所有人，需承担车辆违法（如交通违章、事故赔偿）的法律责任；
     
   • 个人可能因无法证明车辆所有权而面临使用障碍（如年检、保险理赔）。
     建议：双方在合同中明确过户时间及违约责任，并在交易后立即共同办理过户手续。

4. 车辆质量与瑕疵担保责任
   若车辆存在质量问题（如事故车、拼装车、里程表造假等），合作社作为销售方可能需承担《民法典》规定的瑕疵担保责任，包括修理、更换、退货或赔偿损失。若合作社故意隐瞒车辆真实情况，还可能构成欺诈，个人有权要求撤销合同并索赔。
   建议：合作社在销售前应如实告知车辆状况，个人在购车前应仔细检查车辆并保留相关证据（如检测报告、聊天记录）。

5. 合作社内部决策程序问题
   若合作社章程或相关法律法规对固定资产处置有特殊规定（如需经成员大会决议），合作社在未履行内部程序的情况下销售车辆，可能面临内部纠纷或行政处罚。但此情形不影响对外合同的效力，仅涉及合作社与成员之间的责任划分。
   建议：合作社在销售前应确认内部决策程序是否合规，避免因程序瑕疵引发后续问题。

总结：合作社将车辆卖给个人，只要合同合法、税务合规、及时过户且车辆无质量问题，通常不会产生严重法律后果。但若存在合同瑕疵、税务违规、未过户或车辆质量问题，可能面临合同纠纷、税务处罚或民事赔偿等风险。建议您在交易前咨询专业律师，确保流程合法合规。