现金存入公司账户是否会被查，这并非一个绝对的问题，而是取决于多种因素。以下我将从不同角度为你详细分析：
正常经营与合规操作：
- 如果公司现金存入公账是出于正常的经营活动，且所有操作都符合相关法律法规和财务制度，那么这种存款行为通常是不会被查的。公司应当保留好相关的交易凭证和记录，以备税务、审计等部门的检查。
资金来源与用途的合法性：
- 资金来源的合法性是关键。如果现金来源不明或存在非法活动（如洗钱、贪污等），那么存入公账就可能引发监管部门的注意，甚至被调查。
- 同样，资金用途的合法性也很重要。如果资金被用于非法活动或违反公司章程、法律法规的用途，那么也可能面临被查的风险。
税务合规性：
- 公司应当按照税法规定，及时、准确地申报和缴纳税款。如果现金存入公账后，公司未按规定进行税务申报或缴纳税款，那么税务部门可能会对公司进行税务稽查。
- 此外，如果公司存在利用现金交易进行偷税漏税等违法行为，那么一旦被发现，将面临严重的法律后果。
反洗钱与反腐败监管：
- 在当前反洗钱和反腐败的大背景下，金融机构和监管部门对大额现金交易和异常交易都保持着高度警惕。如果公司现金存入公账的行为被认定为异常或可疑交易，那么可能面临被调查的风险。
审计与监管部门的检查：
- 除了税务部门外，审计、工商等监管部门也可能对公司进行定期或不定期的检查。在这些检查中，现金存入公账的行为可能成为检查的重点之一。
法律建议：
- 为了确保公司现金存入公账的行为合法合规，公司应当建立健全的财务管理制度和内部控制机制，确保所有交易都有明确的记录和凭证。
- 公司应当加强对员工的法律培训，提高员工的法律意识和合规意识，避免因为个人行为而给公司带来法律风险。
- 如果公司面临税务、审计等部门的检查或调查，应当积极配合并提供相关证据和资料，以证明公司行为的合法性和合规性。
可能后果：
- 如果公司现金存入公账的行为存在违法违规情况，那么可能面临税务处罚、行政处罚甚至刑事处罚等严重后果。这些后果不仅会影响公司的声誉和信誉，还可能对公司的经营和发展造成严重影响。
总结来说，现金存入公司账户是否会被查，取决于资金来源与用途的合法性、税务合规性、反洗钱与反腐败监管以及审计与监管部门的检查等多种因素。为了确保公司行为的合法合规，公司应当加强财务管理和内部控制，提高员工的法律意识和合规意识。如果你有任何具体的法律问题或疑虑，可以直接向我咨询。