结论前置：员工拿离职证明后，仍然有权申请劳动仲裁，只要与用人单位之间存在未解决的劳动争议，并且在法定的仲裁时效内。

一、离职证明的作用与劳动仲裁的申请资格

离职证明是用人单位在与劳动者解除或终止劳动合同时出具的正式文件，它证明了双方劳动关系的结束。然而，离职证明的开具并不妨碍劳动者依法维护其在劳动关系存续期间的合法权益。根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的相关规定，劳动者与用人单位之间因多种原因产生的劳动争议，包括但不限于劳动关系的确认、劳动合同的订立、履行、变更、解除和终止，以及工作时间、休息休假、社会保险、福利等方面的争议，均可申请劳动仲裁。因此，即使员工已经拿到了离职证明，只要存在上述劳动争议，就有权申请劳动仲裁。

二、常见可申请劳动仲裁的情形

1. 未支付劳动报酬：若用人单位存在拖欠工资、加班费、奖金等行为，即使劳动者已拿到离职证明，也可在仲裁时效内要求用人单位支付相应的款项。
2. 经济补偿问题：如用人单位在解除劳动合同时符合需支付经济补偿的情形但未支付，劳动者可通过劳动仲裁主张经济补偿。例如，用人单位未按《劳动合同法》的规定提前通知劳动者或额外支付一个月工资的情况下解除劳动合同等。
3. 违法解除劳动合同：若用人单位无合法依据即解除劳动合同，属于违法解除，劳动者即便拿到离职证明，也有权通过劳动仲裁要求用人单位支付赔偿金。
4. 未依法缴纳社保：如用人单位在劳动者在职期间未依法为其缴纳社会保险，劳动者可通过劳动仲裁要求用人单位补缴社保费用。
5. 竞业限制补偿金：若双方有竞业限制约定，且劳动者离职后履行了竞业限制义务，但用人单位未支付竞业限制补偿金，劳动者同样可以申请劳动仲裁以主张相应补偿。

三、劳动仲裁的时效与流程

1. 仲裁时效：劳动争议申请仲裁的时效期间通常为一年，自当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。对于劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬等发生的争议，应自劳动关系终止之日起一年内提出。
2. 提交仲裁申请：劳动者需向劳动争议仲裁委员会提交书面仲裁申请，并按被申请人人数提交副本。仲裁申请书应详细载明争议发生的时间、地点、事实和理由等。
3. 准备证据材料：除了离职证明外，劳动者还需准备如工资条、工作记录、劳动合同等相关证据，以支持自己的仲裁请求。这些证据材料将有助于仲裁委员会更全面地了解争议事实，从而作出公正的裁决。

四、实际操作建议

1. 及时咨询：如果你认为自己的权益在劳动关系存续期间或离职过程中受到侵害，建议及时咨询专业律师，了解具体的法律途径和维权策略。
2. 准备充分：在申请劳动仲裁前，务必准备充分的证据材料，以支持自己的仲裁请求。这些证据材料应尽可能全面、客观地反映争议事实。
3. 注意时效：劳动争议申请仲裁的时效期间有限，务必在法定的时效内提出申请，以免丧失维权的机会。

总结：离职证明的开具并不影响劳动者依法申请劳动仲裁的权利。只要劳动者认为自己的权益在劳动关系存续期间或离职过程中受到侵害，且符合申请仲裁的条件和流程要求，就可以依法向劳动争议仲裁委员会提起仲裁申请。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。