在厂房买卖付款原因双方说法不一致时，法院并不会单纯地相信某一方，而是会依据双方提供的证据以及相关法律规定，进行综合判断和认定。以下从几个角度详细分析：

一、证据的重要性

在法律纠纷中，证据是法院判断事实、作出裁决的基础。对于厂房买卖付款原因的争议，双方都需要提供充分的证据来支持自己的说法。这些证据可能包括但不限于：

1. 书面合同：如果双方签订了书面合同，合同中关于付款原因、付款方式、付款时间等条款将是法院判断的重要依据。
2. 付款凭证：如银行转账记录、收据等，这些凭证能够直接证明款项的支付情况。
3. 沟通记录：如邮件、短信、微信等聊天记录，这些记录可能包含双方对付款原因的讨论和确认。
4. 证人证言：如果双方有共同的朋友、合作伙伴或中介等第三方见证人，他们的证言也可能对法院判断事实产生影响。

二、法院的判断原则

在双方说法不一致且证据相互矛盾的情况下，法院会遵循以下原则进行判断：

1. 优势证据原则：法院会倾向于采信证据更为充分、可信度更高的一方的主张。这要求双方不仅要提供证据，还要确保证据的真实性、合法性和关联性。
2. 公平合理原则：法院在判断时会考虑双方的行为是否符合公平合理的原则。例如，如果一方的主张明显违背常理或交易习惯，法院可能会对其主张持怀疑态度。
3. 诚实信用原则：法院会要求双方在诉讼过程中保持诚实信用，不得提供虚假证据或隐瞒重要事实。如果一方被发现存在不诚实行为，其主张可能会受到法院的否定。

三、可能的法律后果

1. 如果法院认定某一方的主张成立：那么该方将获得胜诉判决，对方需要承担相应的法律责任，如支付款项、赔偿损失等。
2. 如果法院无法认定双方的主张：或者认为双方的主张均缺乏充分证据支持，法院可能会根据公平合理原则进行裁决，或者要求双方承担举证不能的法律后果。

四、建议

1. 在交易过程中保留好相关证据：无论是书面合同、付款凭证还是沟通记录，都应妥善保存，以备不时之需。
2. 在发生争议时及时寻求法律帮助：如果双方无法自行协商解决争议，应及时向法院提起诉讼或申请仲裁，并委托专业律师代理案件，以提高胜诉的几率。
3. 遵守诚实信用原则：在诉讼过程中保持诚实信用，不提供虚假证据或隐瞒重要事实，以免受到法律的制裁。

总之，在厂房买卖付款原因双方说法不一致时，法院会依据双方提供的证据以及相关法律规定进行综合判断和认定。因此，双方都应积极提供证据支持自己的主张，并遵守法律程序和诚实信用原则。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。