关于您提出的“租车公司合同保险理赔百分之二十扣款是否合法”的问题，这实际上涉及到租车合同中违约金或扣款条款的合法性评估。以下是我为您提供的详细解答：
一、合法性基础
首先，我们需要明确的是，租车合同中关于保险理赔扣款的约定，其本质类似于违约金条款。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人在签订合同时，有权约定一方违约时向对方支付一定数额的违约金，或约定损失赔偿额的计算方法。这一约定需基于双方真实意思表示，且不违反法律、行政法规的强制性规定及公序良俗，方为有效。
二、扣款比例的合理性评估
与实际损失的关系：
- 保险理赔扣款的核心目的应是补偿租车公司因车辆损坏、事故等导致的实际损失。因此，20%的扣款比例是否合理，关键在于这一比例是否能够合理反映租车公司因车辆损坏等造成的直接和间接损失。
- 如果该比例能够合理覆盖租车公司的维修费用、车辆闲置期间的损失、准备成本等，则通常视为合理。
过高或过低的调整：
- 法律允许在扣款比例过分高于或低于实际损失时，通过法院或仲裁机构进行调整。如果租车公司约定的扣款比例被认为过高，您作为承租方有权请求减少；反之，如果认为过低，租车公司则有权请求增加（但这一情况在租车合同中较为少见）。
三、地区差异与司法实践
- 不同地区的法律法规和司法实践对租车合同中扣款比例的具体规定可能存在差异。部分地区可能对扣款比例设定了上限或下限，超出此范围的可能不被支持。
- 因此，在评估租车合同中保险理赔扣款比例的合法性时，还需考虑当地的特定法律规定和司法实践。
四、实际操作建议
详细阅读合同：
- 在签订租车合同前，务必仔细阅读并理解所有条款，特别是关于保险理赔扣款的约定。确保您清楚了解在何种情况下会触发扣款，以及扣款的具体比例和计算方式。
协商与谈判：
- 如果您认为合同中的保险理赔扣款比例不合理，可以与租车公司进行协商，尝试调整至双方都能接受的数额或计算方式。在协商过程中，您可以提出自己的理由和依据，如实际损失情况、市场惯例等。
寻求法律咨询：
- 面对复杂的法律问题或存在疑问时，建议您及时咨询专业律师或法律机构。他们可以为您提供准确的法律意见和指导，帮助您评估合同条款的合法性，并维护您的合法权益。
综上所述，租车公司合同中约定的保险理赔百分之二十扣款，在大多数情况下可能是合法的，但具体合法性需结合合同条款、实际损失、当地法律法规及双方真实意愿进行综合评估。在实际操作中，建议您详细阅读合同、积极协商，并在必要时寻求法律咨询以确保自身权益。