针对您提出的“注册一般项目但实际从事许可项目应如何处理处罚”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确的是，企业或个体工商户在注册时所登记的经营范围，是其合法开展经营活动的基础。若实际从事的经营项目超出了注册时登记的范围，特别是当实际从事的是需要许可的经营项目时，这就涉及到了违法经营的问题。
对于非许可类的超范围经营： 根据《国务院关于深化“证照分离”改革进一步激发市场主体发展活力的通知》中的规定，企业超经营范围开展非许可类经营活动的，市场监管部门在执法时应采取更为宽容的态度，通常不予处罚，但会通过行政指导等方式督促企业改正。然而，这并不意味着该行为本身是合法的，其违法性并未因此改变。若企业长期、大规模地超范围经营，或涉及消费者权益、公共安全等领域，仍可能面临监管部门的重点监管甚至处罚。
对于许可类的超范围经营： 若企业或个体工商户实际从事的是需要许可的经营项目，但并未取得相应的许可证件，那么这就构成了严重的违法经营行为。根据相关法律法规，行业主管部门将依法对此类行为进行查处，可能包括罚款、没收违法所得、责令停业整顿、吊销营业执照等处罚措施。
具体处理建议：
立即停止违法经营行为：若您或您的企业已经实际从事了超出注册范围的经营项目，特别是许可类项目，应立即停止相关经营活动，以避免进一步的法律风险。
申请变更经营范围或取得相应许可：根据实际经营需要，向市场监管部门申请变更经营范围，或向相关行业主管部门申请取得相应的许可证件。这是合法开展经营活动的必要前提。
配合监管部门的调查和处理：若监管部门已经对您的违法经营行为进行了调查，应积极配合并提供相关证据材料，以便监管部门能够准确了解情况并作出公正的处理决定。
加强内部管理：建立健全内部管理制度，确保企业或个体工商户的经营活动始终符合法律法规的要求，避免类似问题的再次发生。
综上所述，注册一般项目但实际从事许可项目是严重的违法经营行为，可能面临严厉的处罚。因此，建议您或您的企业务必遵守相关法律法规，合法开展经营活动。如有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时咨询市场监管部门或相关行业主管部门。