住宅小区内的违建问题，主要由城市管理综合行政执法部门、城乡规划主管部门以及乡镇人民政府（针对乡、村庄规划区内的小区）负责管理和查处。以下是具体分析：
城市管理综合行政执法部门：
- 职责：该部门负责城市规划区内违反规划建设管理规定的违法建筑的查处工作。对于市区内未经规划许可擅自搭建的建筑物、构筑物，有权责令停止建设、限期拆除，并可组织强制拆除行动。
- 法律依据：根据《城市管理执法办法（2017年版）》第八条，城市管理执法的行政处罚权范围包括住房城乡建设领域法律法规规章规定的行政处罚权，这涵盖了违建行为的查处。
城乡规划主管部门：
- 职责：负责城乡规划的实施监督管理，对未取得建设工程规划许可证或未按许可证规定进行建设的违法建筑进行查处。可依法作出处罚决定，包括责令改正、罚款、限期拆除等。
- 法律依据：依据《中华人民共和国城乡规划法》第六十四条，对于未取得建设工程规划许可证或者未按照建设工程规划许可证的规定进行建设的行为，由县级以上地方人民政府城乡规划主管部门责令停止建设，并根据情况作出相应处罚。
乡镇人民政府（针对乡、村庄规划区内的小区）：
- 职责：对乡、村庄规划区内的违法建设行为有管辖权，可以责令停止建设、限期改正；逾期不改正的，可以拆除。
- 法律依据：根据《中华人民共和国城乡规划法》第六十五条，在乡、村庄规划区内未依法取得乡村建设规划许可证或者未按照乡村建设规划许可证的规定进行建设的，由乡、镇人民政府负责处理。
处理建议与流程：
- 初步沟通协商：发现违建行为后，建议先与邻居或物业进行沟通协商，尝试通过和解方式解决。
- 向相关部门举报：若协商无果，应向当地的城市管理综合行政执法部门或城乡规划主管部门（根据小区所在区域及具体情况选择）进行举报，并提供详细的证据材料，如照片、视频等。
- 配合调查处理：在相关部门进行调查处理过程中，应积极配合，提供必要的信息和支持，如提供违建的具体位置、建设时间等。
- 关注处理结果：对处理结果进行跟踪关注，确保违建行为得到妥善解决。如果处理结果不满意，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼。
补充说明：
- 不同地区可能会根据实际情况对违建管理职责进行调整和明确，可能设立专门的违法建设整治办公室等机构来协调各部门工作。因此，在具体操作时，建议先了解当地的具体管理规定和执法部门职责划分。
- 作为业主或相关利益方，应了解并遵守相关法律法规，不参与违建行为，并积极配合政府部门的执法工作，共同维护小区的规划和秩序。
希望以上分析能对您有所帮助。如果您在处理违建问题时遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。