结论：小额贷款逾期被起诉立案后，是否会冻结有房贷的负价值房产，需根据具体情况判断，但一般情况下，单纯因小额贷款逾期被起诉，不会直接导致有房贷的负价值房产被冻结。不过，若债权人申请财产保全或法院判决后债务人未履行，房产则可能面临被冻结或拍卖的风险。以下从不同角度详细分析：

一、小额贷款逾期被起诉的基本法律后果

小额贷款逾期后，债权人（如银行或贷款公司）有权向法院提起诉讼，要求债务人偿还欠款。若法院受理并立案，债务人将面临法律诉讼程序，包括但不限于出庭应诉、接受法院调解或判决等。单纯的诉讼立案行为，并不会直接导致债务人名下房产被冻结。冻结房产等财产保全措施，通常需要债权人向法院提出申请，并满足一定条件。

二、房产被冻结的条件与程序

1. 债权人申请财产保全：

   • 在诉讼过程中，若债权人担心债务人转移财产，影响判决执行，可以向法院申请财产保全，要求冻结债务人名下的房产、银行账户等财产。
   • 法院在审查债权人的申请后，若认为有必要，会作出财产保全裁定，并通知相关机构（如房产登记部门、银行等）执行冻结措施。

2. 法院判决后执行：

   • 若法院最终判决债务人偿还欠款，而债务人未在规定期限内履行判决，债权人可以向法院申请强制执行。
   • 在强制执行过程中，法院有权查封、冻结、拍卖债务人名下的财产，包括房产，以清偿债务。

三、负价值房产的特殊性

负价值房产通常指的是房产的市场价值低于其剩余贷款金额的情况。即使房产为负价值，也不影响其作为债务人财产的法律属性。在债权人申请财产保全或强制执行时，法院仍可能对该房产采取冻结、查封等措施。不过，在实际操作中，由于房产价值低于贷款金额，拍卖该房产可能无法完全清偿债务，甚至可能无法覆盖拍卖费用，因此法院在决定是否拍卖时会谨慎考虑。

四、债务人应对建议

1. 积极应诉：

   • 面对小额贷款逾期的诉讼，债务人应积极应诉，向法院说明自身情况，争取调解或减轻责任。

2. 与债权人协商：

   • 债务人可以尝试与债权人协商，寻求延期还款、分期还款等解决方案，以避免诉讼和财产保全措施的发生。

3. 关注房产价值变化：

   • 若房产价值确实低于贷款金额，债务人可以关注市场动态，适时采取措施（如提前还款、出售房产等）以降低风险。

4. 咨询专业律师：

   • 在面对复杂的法律问题时，债务人应及时咨询专业律师，了解自身权利和义务，制定合理的应对策略。

最后，小额贷款逾期被起诉立案后，房产是否会被冻结取决于多种因素，包括债权人的申请、法院的判断以及房产的实际价值等。若您面临此类问题，建议直接向我咨询，以便根据您的具体情况提供更详细的法律建议。