关于您提出的“信用卡逾期协商一次性还款是否需要在系统里先把利息去掉再操作还款”的问题，这实际上取决于银行的具体政策、您的个人情况以及协商的结果。以下是我为您详细梳理的解答：

一、利息减免的可能性

1. 银行政策优惠：部分银行为了推广信用卡业务或减少长期不良资产，可能会针对特定情况（如特定推广活动期间）推出利息减免政策。如果您是非恶意逾期，且有明确的还款意愿，银行可能会考虑给予一定的利息减免。

2. 特殊困难情况：如果您因突发重大疾病、遭遇意外事故、失业等不可抗力因素导致逾期，并能提供相关证明材料（如医院诊断证明、费用清单、失业证明等），银行在评估您的实际情况后，可能会酌情考虑减免部分利息。

3. 一般情况：然而，如果您的逾期原因并不符合银行的减免条件，或者银行政策较为严格，那么银行通常不会主动减免利息，而是会按照信用卡领用合约的规定收取逾期利息和费用。

二、协商与还款流程

1. 了解银行政策：首先，您需要主动联系银行客服或前往线下网点，了解银行的逾期利息计算方式及是否有一次性还清减免利息的政策。这是制定还款计划和协商策略的基础。

2. 提出协商请求：在了解银行政策后，您可以向银行明确表达一次性还清欠款的意愿，并诚恳地阐述逾期原因及当前的还款困难。同时，您可以提出减免部分或全部利息的请求。

3. 准备并提交证明材料：根据逾期原因，您需要准备相关证明材料，如疾病诊断证明、费用发票、失业证明等。这些材料将有助于银行评估您的请求是否合理。

4. 等待银行审核与回复：银行会对您的请求和材料进行审核。审核时间因银行而异，一般需要几个工作日至几周不等。在此期间，请保持电话畅通，以便银行与您沟通。

5. 协商并签订还款协议：

   • 如果银行同意减免利息，它会与您协商具体的还款方案，包括减免的利息金额、最终需偿还的本金等。在签订协议前，请务必仔细阅读协议内容，确保理解并接受条款。
   • 如果银行不同意减免利息，您可以进一步协商其他还款方案，如延长还款期限、降低还款压力等。如果无法达成一致，您需要按照信用卡合约规定的金额一次性还清欠款。

三、关于系统操作

• 在协商过程中，您并不需要直接在系统里操作去掉利息。利息的减免或调整通常是在银行审核您的请求并达成协议后，由银行在后台进行处理的。
• 您只需按照协商达成的还款方案，在约定的时间内将款项还入指定的账户即可。

四、注意事项与建议

• 无论是否获得利息减免，都建议您尽快还清欠款，以避免产生更多费用和损害信用记录。
• 未来应努力保持良好的信用习惯，按时还款，避免再次出现逾期等问题。
• 如果在协商过程中遇到复杂情况或难以处理的问题，您可以考虑寻求专业法律或财务咨询师的帮助。

综上所述，信用卡逾期协商一次性还款是否需要先在系统里去掉利息再操作还款，并没有一个固定的答案。它取决于银行的具体政策、您的个人情况以及协商的结果。因此，我建议您主动联系银行客服或前往线下网点进行咨询和协商，以获取最准确和个性化的解答。