分公司注销总公司不同意时，可采取以下综合策略来解决问题并确保各方权益：

1. 了解原因并沟通协商

   • 主动沟通：首先，建议与总公司相关负责人进行深入沟通，了解其不同意注销的具体原因。这些原因可能涉及资产处置、人员安排、内部流程或是对分公司未来价值的考量等。
   • 提出方案：针对总公司的顾虑，可以提出具体可行的解决方案。例如，如果总公司担心资产清算问题，可以制定详细的资产清算计划；如果担心员工安置，可以提出员工安置方案等。通过这些方案，消除总公司的疑虑，争取其支持。

2. 明确决策权与内部治理

   • 查阅章程：仔细审查公司章程及内部规定，明确分公司注销的决策权归属及所需遵循的程序。这有助于确定在总公司不同意的情况下，是否有其他途径可以推动注销进程。
   • 内部申诉：若总公司不予配合，可以向董事会、监事会或其他相关决策机构提交详细的注销报告和理由。通过内部治理机制，如召开股东会或董事会会议，寻求解决途径。

3. 收集证据并考虑法律途径

   • 证据收集：全面收集分公司注销的必要性证明、与总公司的沟通记录、公司章程及相关文件等。这些证据将有助于在后续的法律程序中证明注销的合理性和合法性。
   • 律师函警告：可以委托律师向总公司发送律师函，明确注销的依据、要求及可能的法律后果。律师函作为一种正式的法律文件，往往能促使总公司重新考虑其立场。
   • 提起诉讼或仲裁：若律师函无效，且内部治理机制也无法解决问题，可以考虑向有管辖权的人民法院提起诉讼或申请仲裁。在诉讼或仲裁过程中，可以请求法院判决或裁决总公司配合注销工作。

4. 注意事项

   • 合法合规：在整个注销过程中，务必遵守法律法规及公司章程的规定。确保注销程序的合法性，避免因程序不当而引发新的法律纠纷。
   • 善后处理：妥善处理分公司的善后事宜，包括员工安置、债务清偿、资产清算等。这些工作不仅关系到分公司的顺利注销，也关系到总公司的声誉和利益。
   • 保持冷静与理性：在处理此类复杂问题时，保持冷静和理性至关重要。避免情绪化的决策和行为，以免加剧矛盾或引发不必要的法律风险。

5. 外部协调与支持

   • 行业监管：如果分公司注销涉及行业监管问题，可以向相关监管部门反映情况，寻求其协调和支持。监管部门的介入往往能促使总公司更加重视并配合注销工作。
   • 政府机构：在必要时，也可以向相关政府机构求助。例如，如果分公司注销涉及地方经济发展或就业问题，政府机构可能会出面协调解决。

总结来说，分公司注销总公司不同意时，应综合运用沟通协商、内部治理、法律途径等多种手段来解决问题。在整个过程中，保持冷静、理性，注重证据的收集和保存，并遵循法律法规及公司章程的规定。如果遇到复杂或难以解决的问题，可以直接向我咨询，我将根据具体情况提供专业的法律建议。