结论前置：犯罪嫌疑人在取保候审期间重新犯罪，司法机关将依法没收部分或全部保证金，并可能变更强制措施为逮捕，对新罪与原罪实行数罪并罚。具体处理取决于新犯罪的性质和情节。
法律依据
根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第七十一条的规定，被取保候审的犯罪嫌疑人、被告人应当遵守以下规定：
- 未经执行机关批准不得离开所居住的市、县；
- 住址、工作单位和联系方式发生变动的，在二十四小时以内向执行机关报告；
- 在传讯的时候及时到案；
- 不得以任何形式干扰证人作证；
- 不得毁灭、伪造证据或者串供。
同时，人民法院、人民检察院和公安机关还可以根据案件情况，责令被取保候审的犯罪嫌疑人、被告人遵守以下一项或者多项规定：
- 不得进入特定的场所；
- 不得与特定的人员会见或者通信；
- 不得从事特定的活动；
- 将护照等出入境证件、驾驶证件交执行机关保存。
若被取保候审的犯罪嫌疑人、被告人违反前述规定，已交纳保证金的，司法机关可以没收部分或者全部保证金。重新犯罪显然严重违反了取保候审的规定，表明被取保候审人没有悔改表现，司法机关有权依法没收保证金。
具体操作及考量因素
没收的决定主体与程序：
- 决定主体：一般由负责执行取保候审的公安机关或相关司法机关进行审查和决定。
- 程序要求：发现被取保候审人重新犯罪后，执行机关会调查核实，收集证据，并按照法定程序制作没收保证金的决定书，告知被取保候审人及其家属原因和依据。
保证金没收的幅度：
- 部分没收：适用于新犯罪情节较轻，对原案件司法程序影响较小的情况。例如，因轻微冲突构成的犯罪，且未实质性干扰原案件的侦查或审判。
- 全部没收：适用于新犯罪性质严重，或对原案件司法程序造成重大干扰的情况。例如，严重暴力犯罪或故意逃避侦查、审判的行为。
保证金数额的确定：
- 保证金数额的确定会综合考虑案件性质、犯罪嫌疑人或被告人的社会危险性、经济状况等因素。
- 司法机关会根据当地经济发展水平、案件具体情况在1000元以上确定保证金数额，经济发达地区可能更高。
后续法律后果
变更强制措施：
- 因重新犯罪表明被取保候审人具有较大人身危险性，司法机关通常会变更取保候审为逮捕等更严格的强制措施。
数罪并罚：
- 新罪与原罪将分别处理，并按照数罪并罚的原则进行判决。除死刑和无期徒刑外，一般在总和刑期以下、数刑中最高刑期以上酌情决定执行刑期。
- 新罪被视为加重情节，可能导致比单独处罚两罪更重的刑罚。
对原案件的影响：
- 重新犯罪并被没收保证金表明被取保候审人社会危险性和主观恶性大，可能导致司法机关对原案件处理态度更加严厉，量刑时考虑作为加重处罚的情节。
实际案例说明
假设某犯罪嫌疑人因涉嫌盗窃被取保候审，并交纳了5000元保证金。在取保候审期间，该犯罪嫌疑人再次实施盗窃行为。此时，执行机关将依据《中华人民共和国刑事诉讼法》第七十一条的规定，没收其已交纳的5000元保证金，并根据案件情况决定是否对其采取逮捕等强制措施。同时，新罪与原罪将分别处理，并按照数罪并罚的原则进行判决。
总结：犯罪嫌疑人在取保候审期间重新犯罪，将面临保证金被没收、强制措施变更以及数罪并罚等法律后果。具体处理方式取决于新犯罪的性质和情节，以及司法机关的综合考量。若您有进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，请直接向我咨询。