特种设备长期未办理使用登记的，将面临责令限期改正、罚款等行政处罚，情节严重的还可能面临停产停业整顿等更严厉的处罚措施。具体分析如下：

1. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国特种设备安全法》第三十三条：“特种设备使用单位应当在特种设备投入使用前或者投入使用后三十日内，向负责特种设备安全监督管理的部门办理使用登记，取得使用登记证书。登记标志应当置于该特种设备的显著位置。”
   • 该法第八十三条还规定：“违反本法规定，特种设备使用单位有下列行为之一的，责令限期改正；逾期未改正的，责令停止使用有关特种设备，处一万元以上十万元以下罚款：（一）使用特种设备未按照规定办理使用登记的……”

2. 处罚措施：

   • 责令限期改正：特种设备安全监督管理部门在发现特种设备使用单位未办理使用登记时，会首先责令其限期改正，即要求使用单位在规定的时间内完成使用登记手续。
   • 罚款：如果使用单位在限期内未改正，特种设备安全监督管理部门将对其处以一万元以上十万元以下的罚款。罚款的具体数额会根据违法行为的情节、后果等因素综合确定。
   • 停产停业整顿：在情节严重的情况下，如使用单位拒不改正或者存在其他严重违法行为，特种设备安全监督管理部门还可能责令其停产停业整顿，直至其符合安全要求并办理使用登记手续。

3. 实际应用中的考量因素：

   • 在实际执法过程中，特种设备安全监督管理部门会综合考虑使用单位的违法情节、后果、整改态度等因素，来决定具体的处罚措施和罚款数额。
   • 如果使用单位能够积极配合整改，及时办理使用登记手续，并采取有效措施消除安全隐患，那么可能会从轻或者减轻处罚。

建议：特种设备使用单位应严格遵守相关法律法规，及时办理使用登记手续，确保特种设备的安全运行。如果因特殊原因无法及时办理，应及时向特种设备安全监督管理部门说明情况，并尽快完成整改。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。