在车祸中对方负主要责任、您负次要责任，且您已住院的情况下，您可以按照以下步骤处理：
及时报警并保留证据：
- 无论事故大小，首先应立即报警，确保交警能够及时到场处理，并出具事故责任认定书。这是后续处理事故、索赔等的重要依据。
- 同时，尽可能保留现场照片、视频等证据，以及目击者的联系方式，这些都有助于证明事故责任和损失情况。
接受医疗救治并保留医疗记录：
- 您已住院，应积极配合医生的治疗，确保身体得到妥善照顾。
- 保留好所有医疗记录，包括诊断书、病历、医疗费用发票等，这些将是后续索赔的重要证据。
了解责任比例和赔偿范围：
- 根据交警出具的事故责任认定书，明确双方的责任比例。在您的情况下，对方负主要责任，您负次要责任，这意味着在赔偿时，对方将承担大部分费用，而您可能需要承担一小部分。
- 赔偿范围通常包括医疗费、误工费、护理费、营养费、交通费等因事故导致的直接经济损失。如果事故造成了伤残或死亡，还可能涉及残疾赔偿金、死亡赔偿金等。
与对方及保险公司协商赔偿事宜：
- 在了解责任比例和赔偿范围后，您可以与对方及其保险公司进行协商，就赔偿事宜达成一致。
- 协商时，应提供充分的证据支持您的索赔请求，如医疗记录、费用发票等。
- 如果协商无果，您可以考虑通过法律途径解决争议。
考虑法律途径解决争议（如协商无果）：
- 如果与对方及保险公司的协商未能达成一致，您可以向法院提起诉讼，要求对方按照责任比例赔偿您的损失。
- 在诉讼过程中，您需要提供充分的证据证明您的损失和对方责任，法院将根据事实和法律规定作出判决。
额外建议：
- 保持冷静和理性：在处理事故和索赔过程中，保持冷静和理性至关重要。避免与对方发生争执或冲突，以免加重事态。
- 咨询专业律师：虽然我已经为您提供了一些基本的法律建议，但每个案件的具体情况都有所不同。如果您在处理过程中遇到任何疑问或困难，建议直接向我咨询，我可以根据您的具体情况提供更详细的法律指导和帮助。
可能涉及的法律后果：
- 如果对方拒绝赔偿或赔偿不足，您有权通过法律途径追究其责任，并要求其按照责任比例赔偿您的损失。
- 如果您在事故中也存在过错（如未遵守交通规则等），您可能需要承担相应的法律责任和赔偿义务。但根据您描述的情况，您负次要责任，因此这部分责任相对较小。