药店因销售医疗器械被执法队打假罚款的处罚方式，主要取决于违法行为的性质、情节及后果，具体如下：
一般违法行为处罚：
- 如果药店销售的医疗器械属于未经注册或备案、无合格证明文件、过期、失效或淘汰等情形，但尚未造成严重后果，根据《医疗器械监督管理条例》第八十六条，执法部门会责令改正，没收违法生产经营使用的医疗器械，并处违法所得、违法生产经营使用的医疗器械货值金额15倍以上30倍以下的罚款。若货值金额不足1万元，则处10万元以上15万元以下的罚款。
- 同时，情节严重的，药店的负责人可能会面临5年内的行业禁入，即5年内禁止从事医疗器械生产经营活动，并由有关部门对药店的违法单位的法定代表人或者主要负责人、直接负责的主管人员和其他责任人员处以没收违法行为发生期间自本单位所获收入，并处所获收入30%以上3倍以下的罚款，严重者还会被终身禁止从事医疗器械生产经营活动。
严重违法行为处罚：
- 若药店的违法行为情节严重，如多次违法、销售金额巨大或造成严重后果（如消费者健康受损），除了上述罚款外，还可能面临更严厉的处罚，包括责令停产停业，直至由原发证部门吊销医疗器械注册证、医疗器械生产许可证、医疗器械经营许可证等。
- 在极端情况下，如果药店的违法行为构成犯罪，如生产、销售不符合标准的医用器材罪，还将依法追究刑事责任。根据《刑法》第一百四十五条，销售金额达到一定标准或造成严重后果的，可处三年以下有期徒刑或者拘役，并处销售金额百分之五十以上二倍以下罚金；对人体健康造成严重危害的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处销售金额百分之五十以上二倍以下罚金；后果特别严重的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处销售金额百分之五十以上二倍以下罚金或者没收财产。
其他考虑因素：
- 执法部门在处罚时，还会考虑药店的违法情节、主观过错、是否及时改正等因素，以确定最终的处罚幅度。
- 药店在接到处罚通知后，有权进行陈述和申辩，甚至可以申请行政复议或提起行政诉讼，以维护自己的合法权益。
建议：药店在日常经营中应严格遵守相关法律法规，确保所销售的医疗器械来源合法、质量可靠。如遇到执法检查或处罚，应积极配合执法部门的工作，并咨询专业律师以了解自己的权利和义务。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。