结论：网贷逾期三年后还清，一般情况下不会直接影响配偶申请房贷，但具体是否产生影响还需考虑逾期情况、配偶的信用状况以及贷款机构的具体要求等多种因素。以下从不同角度进行详细分析：
一、逾期记录对个人信用的影响
逾期记录的消除：
- 根据相关规定，个人信用报告中的逾期记录，在还清欠款后，一般会在一定年限（如5年）后自动消除。这意味着，如果网贷逾期三年后已经还清，且距离现在已超过5年，那么该逾期记录在个人信用报告中可能已经不再显示，因此不会对配偶申请房贷产生直接影响。
逾期记录的短期影响：
- 如果逾期记录在还清后未满5年，或者虽然已满5年但贷款机构在审核时仍考虑历史逾期情况，那么该逾期记录可能对配偶申请房贷产生一定影响。不过，这种影响通常是间接的，因为贷款机构主要关注的是配偶本人的信用状况。
二、配偶申请房贷的审核要点
配偶的信用状况：
- 贷款机构在审核房贷申请时，会重点考察配偶的信用状况，包括信用报告中的逾期记录、负债情况、查询记录等。如果配偶的信用状况良好，没有严重的逾期记录或负债问题，那么网贷逾期三年后还清的情况通常不会成为阻碍。
家庭收入与负债比：
- 贷款机构还会考虑家庭的整体收入与负债比，以评估配偶的还款能力。如果家庭收入稳定且足够覆盖房贷及其他负债，那么网贷逾期的情况对房贷申请的影响也会相对较小。
贷款机构的具体要求：
- 不同的贷款机构可能有不同的审核标准和要求。有些机构可能对逾期记录较为宽容，而有些机构则可能较为严格。因此，在申请房贷前，建议配偶先了解目标贷款机构的具体要求，以便有针对性地准备申请材料。
三、建议与注意事项
查询信用报告：
- 在申请房贷前，建议配偶先查询自己的信用报告，了解其中的逾期记录、负债情况等信息。如果发现有不准确的记录或需要解释的情况，可以及时向贷款机构或征信机构提出异议或说明。
保持良好的信用习惯：
- 无论网贷逾期是否已还清，配偶都应保持良好的信用习惯，按时还款、避免逾期等。这有助于提升个人信用评分，增加贷款机构对配偶的信任度。
咨询贷款机构：
- 如果对网贷逾期对房贷申请的影响存在疑虑或不确定的情况，建议配偶直接咨询目标贷款机构的工作人员。他们可以根据具体情况提供更准确的解答和建议。
总结来说，网贷逾期三年后还清，一般情况下不会直接影响配偶申请房贷。但为了确保申请顺利，配偶仍需关注自己的信用状况、家庭收入与负债比以及贷款机构的具体要求等因素。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。