结论：部队军官转业后犯罪被判刑三年，一般情况下不会保留军籍。
分析说明：
军籍的保留与取消原则：
- 军籍是军人身份的象征，与军人的职务、军衔等紧密相关。当军人转业到地方后，其军籍通常会被注销，转而获得地方户籍。
- 如果军人在转业后犯罪并被判刑，这通常意味着其已经违反了国家法律，不再符合保留军籍的条件。军籍的保留与军人的行为表现、遵纪守法情况等密切相关。
转业后犯罪的具体影响：
- 军官转业后，其身份已经转变为地方公民，不再享受军人的特殊待遇和权益。
- 如果转业后的军官犯罪并被判刑，这将对他的个人声誉、职业发展以及社会地位产生严重影响。在这种情况下，保留军籍已经没有实际意义，也不符合军队管理的规定。
相关法律法规的依据：
- 虽然具体的法律法规可能并未直接规定“转业后犯罪判刑三年是否保留军籍”，但根据军队管理的相关规定和原则，以及军人转业后的身份变化，可以推断出在这种情况下军籍通常不会被保留。
- 军队有严格的纪律和规定，对于违反法律的行为，军队会采取相应的纪律处分措施，包括注销军籍等。
特殊情况说明：
- 在极少数特殊情况下，如军官转业后犯罪情节较轻、认罪态度良好且积极配合调查等，可能会有一定的宽大处理。但这种情况非常罕见，且需要满足一系列严格的条件。
- 即使存在特殊情况，也需要经过严格的审查和批准程序，才能决定是否保留军籍。这通常涉及到军队高层领导的决策和军队纪律的严肃性。
建议与行动：
- 对于已经转业并犯罪被判刑的军官来说，最重要的是接受法律的制裁和改造，重新做人。
- 如果对军籍的保留或取消有疑问或不满，可以通过合法途径向相关部门提出申诉或咨询。但在此之前，建议先了解清楚军队管理的相关规定和原则，以及自己的具体情况和法律责任。
如有更多疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。