在内地与港澳同时拥有刑事管辖权的情形下，处理方式主要依据相关法律原则和具体案件情况来确定，核心原则是避免管辖权冲突，确保案件得到公正、有效的处理，通常会通过协商、指定管辖或依据特别法律规定来确定由哪一方行使管辖权。具体来说：
协商确定管辖权：
- 当内地与港澳对同一案件都拥有刑事管辖权时，首先可以通过协商的方式来解决管辖权的问题。
- 协商可以基于案件的性质、犯罪地、犯罪嫌疑人或被告人的国籍或居住地、以及便于诉讼和审判等因素进行。
- 通过协商，可以达成一致意见，确定由哪一方来行使管辖权，从而避免管辖权的冲突和重复。
指定管辖：
- 在某些情况下，如果协商无法达成一致意见，或者协商不适用，可以通过指定管辖的方式来确定管辖权。
- 指定管辖可以由共同的上级机关或者相关法律规定的机关来进行，以确保管辖权的合理分配和有效行使。
- 指定管辖时，会综合考虑案件的具体情况、各方的利益以及诉讼的便利性等因素。
依据特别法律规定：
- 对于内地与港澳之间的刑事管辖权问题，还可能存在一些特别的法律规定或协议。
- 这些特别法律规定或协议可能针对特定类型的案件或特定情况下的管辖权分配进行了明确规定。
- 在处理相关案件时，应依据这些特别法律规定或协议来确定管辖权。
实际应用中的考量因素：
- 案件性质与严重程度：对于严重犯罪或具有重大影响的案件，可能更倾向于由具有更丰富资源和经验的司法机关来行使管辖权。
- 犯罪地与犯罪嫌疑人/被告人的关联：犯罪地或犯罪嫌疑人/被告人的国籍、居住地等因素也可能影响管辖权的确定。
- 诉讼便利性与效率：选择管辖权时，还会考虑诉讼的便利性和效率，以确保案件能够得到及时、有效的处理。
举例说明：
假设一起犯罪行为同时涉及内地和港澳地区，且两地都对该犯罪行为拥有刑事管辖权。在这种情况下，两地司法机关可以通过协商，根据案件的具体情况、犯罪地的分布、犯罪嫌疑人的国籍或居住地等因素，来确定由哪一方来行使管辖权。如果协商无法达成一致意见，或者案件涉及特别法律规定的情况，那么可以依据相关法律规定或协议，通过指定管辖的方式来确定管辖权。
在处理内地与港澳同时拥有刑事管辖权的案件时，应综合考虑各种因素，确保管辖权的合理分配和有效行使。如果你有具体的案件或法律问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律解答。