程序员加班费的计算需根据具体加班情形，结合我国《劳动法》及相关规定来确定，核心结论如下：

1. 工作日加班
   若程序员在标准工作日（周一至周五）超出8小时工作，超出部分属于工作日加班。根据《劳动法》第四十四条，用人单位应支付不低于工资的150%作为加班费。计算基数通常为劳动合同约定的基本工资，若未约定则参考实际工资水平。

2. 休息日加班
   若程序员在周末（周六、周日）加班且未安排补休，根据《劳动法》第四十四条，用人单位需支付不低于工资的200%作为加班费。若用人单位已安排补休，则无需支付加班费，但补休需在合理期限内完成（如1个月内）。

3. 法定节假日加班
   若程序员在法定节假日（如春节、国庆等）加班，根据《劳动法》第四十四条，用人单位必须支付不低于工资的300%作为加班费，且不得以补休替代。这是法定强制性规定，用人单位必须遵守。

补充说明：

• 加班费计算基数：若劳动合同未明确约定基本工资，可参考实际工资构成中的固定部分（如岗位工资、技能工资等），但需排除奖金、津贴等浮动部分。
  
• 举证责任：若程序员主张加班费，需提供加班证据（如考勤记录、加班审批单、工作邮件等），否则可能因举证不足而败诉。
  
• 特殊情形：若程序员与用人单位约定了“包薪制”（即固定工资包含加班费），需确保该约定不低于当地最低工资标准，且能明确区分正常工资与加班费部分，否则可能被认定为无效。

建议：
若程序员遇到加班费纠纷，可先与用人单位协商；协商不成，可向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。如有具体问题，欢迎直接向我咨询。