当您在申请工伤认定时，如果发现提交的材料不全，不必过于担心，因为社会保险行政部门会对此情况进行相应的处理。以下是针对您问题的详细解答：
首先，您需要明确的是，申请工伤认定时，通常需要提交以下关键材料：工伤认定申请表、与用人单位存在劳动关系（包括事实劳动关系）的证明材料，以及医疗诊断证明或者职业病诊断证明书（或者职业病诊断鉴定书）。工伤认定申请表应当详细填写事故发生的时间、地点、原因以及职工伤害程度等基本情况。
如果您在提交申请时发现材料不全，社会保险行政部门会采取以下措施：
一次性书面告知：社会保险行政部门会一次性书面告知您需要补正的全部材料。这是为了确保您能够清楚了解哪些材料是缺失的，从而有针对性地进行补充。
补正材料：在收到书面告知后，您需要按照要求尽快补正所有缺失的材料。这可能包括与用人单位的劳动关系证明、更详细的医疗诊断证明等。
重新提交与受理：当您补正了所有材料后，需要重新提交工伤认定申请。此时，社会保险行政部门会对您提交的完整材料进行审核，并决定是否受理您的申请。
工伤认定时限：需要注意的是，工伤认定时限的起算时间为受理工伤认定申请之日，即您按规定完整地提交了申请材料之日。如果您提交的材料不完整，时限将从材料补齐之日起开始计算。因此，为了尽快获得工伤认定结果，建议您尽快补正材料并重新提交申请。
工伤认定决定送达：一旦社会保险行政部门作出工伤认定决定，他们会在20日内将《认定工伤决定书》或者《不予认定工伤决定书》送达给您（或者您的近亲属）和您所在的用人单位，并抄送社会保险经办机构。
总之，如果您在申请工伤认定时发现材料不全，不要慌张。按照社会保险行政部门的书面告知要求补正材料，并尽快重新提交申请。这样，您就能够顺利推进工伤认定流程，并尽快获得相应的工伤保险待遇。