在经济犯罪案件中，是否会查每一笔经济来源，需结合案件具体情况判断，并非绝对逐笔核查，但关键资金流向必然会被重点审查。具体分析如下：

1. 案件性质与严重程度
   若案件涉及金额特别巨大（如数千万以上）、影响范围广（如跨省或涉及公众利益），或存在复杂资金链（如通过多层空壳公司转移资金），侦查机关通常会全面审查所有经济往来，包括银行流水、交易合同、发票等，以构建完整的证据链。例如，在非法集资案件中，需核查每一笔投资款的来源及去向，以确定集资规模及资金用途。

2. 资金流向的关联性
   即使不核查每一笔资金，侦查机关会重点审查与犯罪行为直接相关的资金。例如：

   • 在贪污案件中，会核查公款账户的异常支出；
     
   • 在洗钱案件中，会追踪可疑资金的转移路径；
     
   • 在虚开发票案件中，会核对资金回流与发票开具的匹配性。
     若某笔资金与犯罪无关（如个人合法收入），通常不会被深入调查。

3. 侦查资源与效率的平衡
   实践中，侦查机关会优先核查关键证据，如大额转账、频繁交易或异常账户。若案件事实已通过部分证据清晰呈现（如主要犯罪嫌疑人认罪），可能不会对所有资金逐一审查。但若存在证据矛盾或嫌疑人辩解，则会扩大核查范围以排除合理怀疑。

4. 技术手段的辅助
   目前，公安机关可通过“资金分析系统”等工具，快速筛选可疑交易（如夜间大额转账、频繁更换交易对手等），并针对这些交易重点核查。这大幅提高了效率，但并不意味着“每一笔”都会被人工审查。

建议：若您或您身边的人涉及经济犯罪案件，需重点关注与犯罪行为直接相关的资金往来，并提前整理合法收入证明（如工资单、投资收益凭证等），以区分合法与非法资金。如有具体案件细节，可直接向我咨询，我会结合事实与法律为您分析风险。