结论：做三期鉴定材料不全并不意味着费用就白交了，具体是否白交需视情况而定，包括鉴定机构的规定、双方合同约定以及材料不全的原因等。
分析说明：
鉴定机构的规定：
- 不同的鉴定机构对于材料不全的处理方式可能有所不同。有些机构可能会给予一定的宽限期，允许在规定时间内补齐材料；而有些机构则可能直接视为放弃鉴定，费用不予退还。
- 因此，在遇到材料不全的情况时，首先应查阅与鉴定机构签订的合同或协议，了解其中关于材料不全的具体规定。
双方合同约定：
- 如果在委托鉴定时，双方已经就材料不全的情况进行了明确约定，比如约定了补齐材料的期限、费用退还的条件等，那么应按照合同约定来处理。
- 合同是双方意思表示一致的产物，具有法律约束力。因此，在合同有明确约定的情况下，应优先遵循合同约定。
材料不全的原因：
- 如果材料不全是由于鉴定机构的原因导致的，比如鉴定机构未明确告知需要哪些材料、鉴定机构在接收材料时遗漏了部分材料等，那么鉴定机构应承担相应的责任，费用不应由委托人承担。
- 如果材料不全是由于委托人自身的原因导致的，比如委托人未按照鉴定机构的要求提供完整的材料、委托人提供的材料存在瑕疵等，那么委托人可能需要承担一定的责任，费用是否退还则需根据具体情况和合同约定来判断。
法律建议：
- 在遇到材料不全的情况时，首先应与鉴定机构进行沟通，了解其对于材料不全的处理方式和规定。
- 同时，查阅与鉴定机构签订的合同或协议，了解其中关于材料不全的具体约定。
- 如果材料不全是由于鉴定机构的原因导致的，可以要求鉴定机构承担相应的责任；如果材料不全是由于自身原因导致的，则应积极与鉴定机构协商解决方案，尽量减少损失。
- 如果双方无法就材料不全的问题达成一致意见，可以考虑通过法律途径解决纠纷，比如向法院提起诉讼或申请仲裁等。
后续行动：
- 如果您已经遇到了材料不全导致费用问题的情况，建议您先与鉴定机构进行协商，尝试达成一个双方都能接受的解决方案。
- 如果协商无果，您可以考虑咨询专业律师（当然，您可以直接向我咨询，我专注于婚姻家庭、合同纠纷领域），了解您的法律权益和可能的维权途径。
- 在处理此类问题时，务必保留好相关证据，如合同、缴费凭证、沟通记录等，以便在需要时提供证明。