关于您提出的“刑法第88条第二款怎么适用”的问题，首先需要明确的是，您可能指的是与追诉时效相关的条款，但直接提及的是“第88条第二款”，而通常我们讨论追诉时效延长时会涉及到的是《中华人民共和国刑法》第八十八条的整体内容，特别是关于追诉期限延长的规定。不过，为了直接回应您的询问，并假设您想了解的是与追诉时效延长相关的类似法律精神的适用（尽管具体条款号可能有误，因为直接的第88条第二款并非广泛讨论的焦点，且不同版本刑法条文序号可能因修订而有所变化，但核心意思关于追诉时效的延长是关键），我将基于追诉时效延长的法律原则来解答。

追诉时效延长的法律原则及适用：

在《中华人民共和国刑法》中，关于追诉时效，通常规定了一定的期限，如法定最高刑为不满五年有期徒刑的，追诉期限是五年；法定最高刑为五年以上不满十年有期徒刑的，追诉期限是十年，以此类推。然而，存在某些情形下，追诉时效可以延长，这主要体现在：

1. 在人民检察院、公安机关、国家安全机关立案侦查或者在人民法院受理案件以后，逃避侦查或者审判的：

   • 如果犯罪嫌疑人在案件被立案侦查或受理以后，通过逃避侦查或审判的方式，使得案件无法正常进行，那么追诉时效将不受上述期限的限制，即可以无限期追诉。

2. 被害人在追诉期限内提出控告，人民法院、人民检察院、公安机关应当立案而不予立案的：

   • 在这种情况下，如果被害人已经提出了控告，但相关机关未予立案，且这种不立案并非由于被害人方面的原因（如证据不足等客观原因），那么追诉时效同样不受限制，可以追诉。

关于“适用”的具体说明：

• 证据收集与审查：在适用追诉时效延长的规定时，关键在于收集和审查能够证明犯罪嫌疑人逃避侦查或审判，或者被害人已提出控告而相关机关未予立案的证据。
• 法律程序：一旦满足追诉时效延长的条件，相关机关（如检察院、法院）将依法启动或继续刑事诉讼程序，不受原追诉期限的限制。
• 司法实践：在司法实践中，对于追诉时效延长的适用需要严格把握条件，确保既不放过犯罪，也不滥用追诉权，维护法律的公正和权威。

建议：

• 如果您或他人涉及具体案件，且对追诉时效的延长有疑问，建议咨询专业律师，以便根据具体情况提供准确的法律意见。
• 对于法律条文的准确理解和适用，应参考最新的法律法规和司法解释，以确保法律适用的准确性和合法性。

虽然您询问的是“刑法第88条第二款”，但基于上述分析，我提供了关于追诉时效延长的法律原则及适用说明，这在实际法律实践中是更为常见和重要的内容。如果您指的是其他具体条款或情境，请提供更多信息，以便我能给出更精确的解答。